Estudio del efecto antinflamatorio de los componentes de C. citratus mediante el Cribado Virtual sobre la red biológica de la enfermedad de Chagas

GÓMEZ CHÁVEZ JOSÉ LEONARDO; CONTI GERMAN ANDRES; ANGELINA, EMILIO LUIS; PERUCHENA, NELIDA M.

Simposio; Simposio de Estudiantes Hispanohablantes de Bioinformática y Biología Computacional; 2022

Argentina.IntroducciónLa enfermedad de Chagas (Ech) causada por Trypanosoma cruzi dispone de tratamientos poco efectivos durante la fase crónica, etapa donde extractos de Cymbopogon citratus (CC) han demostrado ser efectivos.ObjetivoComprender los mecanismos moleculares de la acción antiinflamatoria del extracto de CC en la miocardiopatía chagásica, mediante docking molecular sobre los Hubs de las redes de interacciones proteína-proteína (PPI) asociadas a la ECh. Materiales y métodos Se utilizó el dataset GSE41089 (https://www.ncbi.nlm.nih.gov/geo/query/acc.cgi?acc=GSE41089) constituido por datos de expresión génica en corazón de ratones infectados con T.cruzi.El procesado, expresión diferencial, enriquecimiento de Ontología génica (GO) y pathways e interacciones proteína-proteína (PPI) fueron obtenidos con Oligo, LIMMA, TopGO, SPIA y STRINGdb respectivamente, disponibles en Bioconductor(http://www.bioconductor.org).Las estructuras fueron obtenidas de Protein Data Bank (https://www.rcsb.org/) y AlphaFold DB (https://alphafold.ebi.ac.uk/), mientras que los compuestos de CC mediante revisión bibliográfica.El docking molecular fue realizado con Autodock-vina y las dinámicas moleculares (DM) con AMBER16.ResultadosEl enriquecimiento funcional de genes sobreexpresados del dataset GSE41089 (logFold-Change>1 y p-valor ajustado