Caracterización plastómica de especies de Paspalum (Poaceae) del grupo Notata

PERICHON, MARÍA C.; REUTEMANN, ANNA V.; DAVIÑA, JULIO R.; MARTÍNEZ, ERIC J.; VALLS, JOSÉ F.M.; RUA, GABRIEL H.; CARBALLO, M.A.; ROMASCHENKO, K.; PETERSON, P.; HONFI, ANA I.

Corrientes

Congreso; L Congreso Argentino de Genética. II Jornadas Regionales SAG-NEA; 2022

Sociedad Argentina de Genética

El grupo Notata s.l., del género Paspalum, reúne a especies de interés forrajero que son morfológicamente muy similares entre sí y presentan diferentes niveles de ploidía en base a x = 10. Se estudiaron los genomas del cloroplasto (plastomas) de 6 especies del grupo, a partir del ADN genómico total. Se prepararon bibliotecas genómicas y se secuenciaron utilizando tecnología de secuenciación de alto rendimiento (genome skimming). Las secuencias limpias fueron ensambladas de novo usando el programa NOVOplasty (version 2.7.2) con dos tamaños de kmers (21 y 33 nucleótidos). Se logró ensamblar, circularizar y anotar 6 genomas de cloroplastos de las siguientes especies: P. barretoi H3025, P. cerradoense RCO&CWFagg2787 y P. cromyorhizon H1732 con 2n = 2x = 20, P. ellipticum ACM115 con 2n = 8x = 80, P. minus V15484 con 2n = 5x = 50, P. notatum H1961 con 2n = 2x = 20 y H2690RB8 2n = 4x = 40. Los plastomas fueron anotados y visualizados utilizando los programas GESeq, IRSCREEN y OGDRAW. Las anotaciones incluyen genes, pseudogenes, y regiones invertidas, entre otras. Los análisis genómicos en progreso incluyen comparaciones estructurales entre genomas, identificación de regiones propensas a mutaciones, útiles para estudios poblacionales, y evaluación de tipos de selección en los genes.