Enfoque polifásico para la identificación de Alternaria spp. aisladas de alimentos

DA CRUZ CABRAL, L.; NIELSEN, K.F.; STENGLEIN, S.; FERNÁNDEZ PINTO, V.; PATRIARCA, A.

Foz Iguazu

Congreso; XII Congreso Latino Americano de Microbiología e Higiene de Alimentos (MICROAL 2014); 2014

Alternaria es un contaminante frecuente de cultivos, capaz de producir micotoxinas. Abarca una gran diversidad morfológica y ha habido muchos intentos para organizarlo en subgéneros. La clasificación de Simmons (2007) divide el género en 14 grupos-especie (g-e) según su patrón de esporulación en condiciones estandarizadas. Debido a la plasticidad de estos patrones entre especies, es fundamental realizar un enfoque polifásico para lograr una identificación precisa. Se identificaron 45 cepas de Alternaria aisladas de alimentos (14 de tomate, 14 de pimiento, 15 de trigo y 2 de arándanos) según Simmons (2007). La determinación de metabolitos secundarios se realizó en DRYES (14 días a 25°C), seguido de extracción a micro escala, según Andersen y col. (2009). La detección se realizó en HPLC-DAD acoplado a EM ESI-TOF. Se amplificó una región del gen de endopoligalacturonasa utilizando cebadores específicos (endoPG3 y endoPG2b) y se secuenció el fragmento amplificado. Los aislamientos se identificaron por morfología como pertenecientes al g-e A. tenuissima (29/45) y A. arborescens (11/45). El resto de las cepas presentó características intermedias entre estos grupos y el g-e A. alternata, y se clasificaron como Alternaria spp. Por análisis del perfil de producción de metabolitos secundarios no se encontró ningún compuesto representativo de grupo, presentando todos los aislamientos perfiles superpuestos. El estudio de las secuencias del fragmento de endoPG tampoco mostró características distintivas dentro de cada grupo. La comparación de las secuencias con bases de datos (BLAST-NCBI) mostró superposición y alto porcentaje de similitud (> 90%) con especies dentro de estos tres g-e.