Rodopsinas de altura: de Baltoro a la Puna

ELIAS, D; KURTH, D; FARIAS, ME

Encarnación, Paraguay

Jornada; XXV Jornadas de Jovenes Investigadores AUGM; 2017

Asociación de Universidades Grupo Montevideo

La Puna es un altiplano que se encuentra en el área central de la cordillera de los Andes y secaracteriza por ser un ambiente extremo. En esta clase de ambientes es probable encontrarcomunidades microbianas cuyo metabolismo depende principalmente de recursos noorgánicos, como la luz solar.Las rodopsinas son proteínas transmembrana que al interactuar con el retinol pueden captar laluz y realizar distintas funciones.El objetivo de este estudio fue determinar si la abundancia y tipo de rodopsinas microbianasde lagunas de la Puna difieren a las de otros ambientes. Para ello, se procesaron 5metagenomas de lagunas de la Puna, junto con 883 metagenomas de otros ambientesdisponibles en EBI Metagenomics. El procesamiento comenzó por la detección de lecturasvinculadas a rodopsinas, usando el programa HMMER con el perfil de Micrhode. Y continuócon su ensamblado utilizando el programa MEGAHIT. Luego se detectaron los fragmentosde rodopsinas con FragGeneScan y HMMER, evaluando la longitud, score, cobertura yregión donde se alineaban. Posteriormente se ubicaron los fragmentos en el árbol filogenéticode Micrhode con PPLACER. Y por último, se agruparon los metagenomas en función de laproporción de lecturas asociadas a los clados del árbol.El principal resultado fue quela mayor proporción de lecturas vinculadas a rodopsinas de laPuna se ubicó en un único clado, junto a los de crioconitas de los glaciares alpinos Forni(Italia) y Baltoro (Pakistán), que se encuentran a más de 2600 metros de altura. Dicho cladoestaría relacionado a las xantorodopsinas, las cuales son rodopsinas bacterianas quefuncionan como bombas de protones asociadas a pigmentos antena. Este hallazgo indicaríaque la luz solar es de vital importancia para estas comunidades.