Evaluación y selección de cebadores para la detección de Salmonella spp. utilizando simulación computacional

REYES, SARITA ISABEL; POMA, HUGO RAMIRO; RAJAL, VERONICA BEATRIZ; HÉCTOR A. CRISTÓBAL

Salta

Jornada; VIII Jornadas de la Facultad de Ciencias Naturales, VI Jornadas de Enseñanza de las Ciencias Naturales, II Jornadas de la Unidad Integrada INTA-UNSa; 2017

La presencia de microorganismos patógenos en aguas recreativas representa un riesgo para lasalud humana. Salmonella es género de bacterias patógenas, de elevada prevalencia en aguasy alimentos, y uno de los principales agentes causantes de enfermedades gastrointestinales enhumanos y animales. La detección de Salmonella mediante técnicas moleculares, tal como laPCR cuantitativa, representa ventajas en cuanto a su rapidez, especificidad y sensibilidad. Losgenes de virulencia son empleados como marcadores moleculares en la detección de gruposde patógenos bacterianos, tal como el gen invA, cuya secuencia se encuentra conservada enSalmonella y codifica para una proteína de invasión. En estudios previos, se informa laevaluación de cebadores mediante análisis bioinformáticos, alternativa que permite optimizarcosto y tiempo. El objetivo del presente trabajo fue evaluar cebadores que permitan detectarSalmonella spp. patógenas presente en dos bases de datos genéticas. Nueve pares decebadores fueron empleados para validar la detección de Salmonella spp. mediante laamplificación in silico del gen InvA. Para este fin, se emplearon algoritmos computacionalesde la base de datos Primer-Blast del NCBI y de PCR In silico. Por otro lado, se determinaronlas posiciones de unión de cebadores en el gen invA mediante el uso del programa DNAMAN.Los resultados del análisis de la simulación de PCR muestran que los cebadores (INVA3F - INVA 3R) son los más promisorios para la detección de aproximadamente 76 y 22serovariedades de Salmonella del NCBI e In silico PCR, respectivamente. Cabe destacar queel 67% de los cebadores analizados se localizan entre posiciones 166 y 661 pb del gen invA,región conservada y óptima como marcador. Los análisis bioinformáticos son herramientasválidas para evaluar y seleccionar cebadores que permitan la amplificación de marcadoresmoleculares en la detección de patógenos bacterianos.