INVESTIGADORES
CASTRILLO Maria lorena
congresos y reuniones científicas
Título:
EVALUACION IN SILICO DE LA DIVERSIDAD GENETICA EN SECUENCIAS NUCLEOTÍDICAS ITS DEL HONGO BIOCONTROLADOR ESCOVOPSIS
Autor/es:
BARENGO, MP; BICH, GA; CASTRILLO, ML; VILLALBA, LL; ZAPATA, PD
Lugar:
Posadas
Reunión:
Jornada; VII Jornadas de Estudiantes de Bioquímica. Dra Martha Medvedeff; 2017
Resumen:
INTRODUCCION- En la provincia de Misiones, una de las principales plagas que afecta el sector foresto-industrial son las hormigas cortadoras de hojas. El método de control biológico emergió como un método alternativo, innovador y ecoamigable. Los hongos micoparásitos del género Escovopsis (Ascomycota: Hipocreales) se consideran de gran importancia para el control biológico de las hormigas cortadoras de hojas, ya que son capaces de matar al Leucoagaricus, principal alimento de los hormigas cortadoras.El éxito dentro de las prácticas de control biológico ha impulsado un interés en la identificación genética de cepas particulares y en las diferencias moleculares entre ellas. Numerosos estudios han reportado el uso de secuencias de ADN ribosómico para explorar la variabilidad genética entre cepas fúngicas. Las secuencias del gen de ARN ribosómico nuclear con grados de conservación observados a lo largo de la evolución han permitido la comparación filogenética entre especies.Marcadores genéticos como los polimorfismos en la longitud de los fragmentos de restricción obtenidos por PCR (Polymerase Chain Rreaction ? Restriction Fragment Length polymorphism o PCR-RFLP) son ampliamente utilizados en organismos como las plantas en particular para la evaluación de relaciones genéticas. La comparación intraespecífica de hongos ha mostrado una preponderancia de polimorfismo de secuencias dentro de las regiones espaciadoras transcritas internas (ITS). Esta variabilidad genética puede ser utilizada para estudiar relaciones filogenéticas entre organismos. Por tanto, para este propósito, el análisis in silico de Polimorfismos de Longitud de Fragmentos de Restricción (RFLP) de secuencias ITS puede ser una herramienta de ecología molecular útil para evaluar la diversidad fúngica inter e intraespecífica. OBJETIVO Evaluar in silico la variabilidad genética en secuencias ITS-RFLP de diferentes especies del género Escovopsis MATERIALES Y METODOS-Búsqueda de secuencias de la región ITS para especies de Escovopsis: En la base de datos molecular del NCBI-GenBank se buscaron y recuperaron 6 secuencias caracterizadas y publicadas de cepas de Escovopsis de distinta procedencia geográfica.-Alineamiento y análisis de las secuencias: se alinearon las 6 secuencias de la región ITS, y se recortaron los extremos con la finalidad de obtener secuencias de longitud similar. Con la finalidad de evaluar la variabilidad genética entre estas secuencias, se ensayó la digestión in silico con las enzimas de restricción EcoRI, EcoRII, HhaI, NotI y AluI. Para este fin se utilizó el software Geneious versión 9.1.5 para Windows. RESULTADOSLa digestión in silico permitió evaluar la variabilidad genética de las secuencias ITS de 6 cepas de Escovopsis en función de sus patrones de restricción. Las enzimas de restricción evaluadas que permitieron detectar polimorfismos en todas las cepas de Escovopsis fueron EcoRI, EcoRII y HhaI. Particularmente, la enzima de restricción HhaI, de corte frecuente, permitió diferenciar cepas de E. weberi según su procedencia geográfica, con patrones de bandas de restricción distintos para Misiones y Brasil. Ademas, las secuencias ITS de las cepas de E. weberi procedentes de Brasil, presentaron patrones de bandas similares con las diferentes enzimas de restricción, a diferencia de las cepas de E. weberi procedentes de Misiones.El patrón de bandas de digestión de E. aspergilloides, procedente de Trinidad y Tobago, se diferenció de todas las cepas, indicando mayor variabilidad genética.CONCLUSION-La técnica bioinformática de ITS-RFLP en las condiciones evaluadas, permitió conocer in silico la diversidad genética entre las secuencias ITS de Escovopsis. La enzima de restricción HhaI permitió diferenciar a las cepas en estudios de acuerdo a su procedencia geográfica, por lo cual podría considerarse para su evaluación en condiciones de laboratorio.