INVESTIGADORES
CASTRILLO Maria lorena
congresos y reuniones científicas
Título:
Análisis in silico de la región estructural y reguladora de dos variantes del gen que codifica para la enzima β-1,3-exoglucanasa en Trichoderma koningiopsis
Autor/es:
SOAREZ, JN; CASTRILLO, ML; BICH, GA; AMERIO, NS; SAPARRAT, MCN; ZAPATA, PD; VILLALBA, LL
Lugar:
Mar del Plata
Reunión:
Congreso; IV Congreso Argentino de Microbiología Agrícola y Ambiental - I Jornada de Microbiología General - IV CAMAyA - I MicroGen; 2018
Resumen:
Uno de los mecanismos por medio del cual los hongos antagonistas de Trichoderma controlan hongos fitopatógenos es la degradación de la pared celular, específicamente el polímero β-1,3-glucano. Los sistemas enzimáticos involucrados por Trichoderma en este proceso incluyen la acción sinérgica de la β-1,3-endoglucanasa y β-1,3-exoglucanasa. La caracterización de las secuencias génicas que codifican estas enzimas son herramientas prometedoras para diseñar un eficaz control. Por lo tanto, se propuso analizar las secuencias estructurales y reguladoras de dos variantes del gen que codifica para la enzima β-1,3-exoglucanasa de la cepa T. koningiopsis POS7. A partir de secuencias génicas disponibles que codifican para la enzima β-1,3-exoglucanasa en diferentes especies del género Trichoderma, se generaron secuencias consensos que se mapearon con los 7.773.936 reads del aislamiento T. koningiopsis POS7 utilizando el software Geneious 9.1.5. Los software libres Clustal Omega e Integrative Genomics Viewer fueron utilizados para analizar las regiones exónicas e intrónicas de la región estructural de dos genes, así como también sus regiones reguladoras.De la variante 1 del gen β-1,3-exoglucanasa se obtuvo una secuencia génica estructural de 5234 pb, con 11 exones y 10 intrones, y una región reguladora de 824 pb. En esta última se localizaron 3 cajas TATA, 1 caja CAAT, 2 cajas CAAT invertidas. Además se identificaron varios elementos de respuesta: 3 relacionadas a la represión catabólica por nitrógeno, 2 corresponden a la represión catabólica por carbono, 1 corresponde al estrés fisiológico y 1 sitio de unión putativo para la proteína con funciones reguladoras durante el parasitismo.De la variante 2 del gen β-1,3-exoglucanasa se obtuvo una secuencia génica estructural de 2310 pb, con 1 exón y una región reguladora de 827 pb. En esta última se localizaron 6 cajas TATA, 1 caja CAAT y 1 caja CAAT invertida. Además se identificaron varios elementos de respuesta: 2 que corresponden a represión catabólica por carbono, 1 relacionada a la represión por nitrógeno, 2 que corresponden al estrés fisiológico y 1 sitio de unión putativo para la proteína con funciones reguladoras durante el parasitismo.Puesto que T. koningiopsis POS7 es portadora en su genoma de dos variantes del gen que codifica para la enzima β-1,3-exoglucanasa, futuros estudios de expresión revelarán si existe contribución diferencial de cada una de ellas en el biocontrol de hongos fitopatógenos.