Caracterización de marcadores moleculares microsatélites para estudios poblacionales de Pinus taeda y Araucaria angustifolia.

CARIAGA-MARTINEZ, ZAPATA, PEDRINI, TEZA, RODRIGUEZ, TORO

2005-11-01

2007-11-30

Biológica

Agropecuario

El objetivo principal del proyecto es obtener un conjunto de marcadores genéticos (microsatélites) en correspondencia con las poblaciones y forestaciones de Araucaria angustifolia  y Pinus taeda. Esto permitirá relacionar el perfil genético con determinadas características fenotípicas, pudiendo aplicarse a la certificación de calidad en la producción forestal o a la selección de ejemplares de especies nativas. Teniendo en cuenta que el objetivo del proyecto es obtener un conjunto de marcadores genéticos (microsatélites) que permitan analizar poblaciones y forestaciones de las especies Pinus taeda y Araucaria angustifolia, hemos definido 5 objetivos específicos. Atendiendo a estos objetivos, las principales tareas y los aspectos sobresalientes de cada uno son: Ø      El primer objetivo es delimitar, analizar ecológicamente y muestrear poblaciones naturales y forestaciones de Araucaria angustifolia y de Pinus taeda. De esta manera se determinarán las características ecológicas y estructurales de las poblaciones de pino Paraná, asignándose un registro de procedencia. Asimismo las forestaciones de Pinus taeda deberán registrarse y en ambos casos seleccionar los individuos que por sus características fenotípicas son más representativos. Los individuos seleccionados serán muestreados. Ø      El segundo objetivo es obtener DNA genómico de las muestras colectadas, planteándose primeramente la estandarización en la extracción de DNA genómico de las especies en estudio. Para ello se aplicarán diversas técnicas descriptas para extracción de DNA vegetal, seleccionando la más adecuada en calidad y cantidad. Con la metodología seleccionada se obtendrá genoma de los individuos colectados en la etapa anterior. Ø      El tercer objetivo es diseñar primers específicos mediante herramientas bioinformáticas y a partir de datos genómicos disponibles para regiones microsatélites de las especies en cuestión o de ser necesario a partir de regiones descriptas para especies del mismo género. Ø      El cuanto objetivo busca estandarizar las condiciones para las amplificaciones, que se llevarán a cabo por PCR, y posteriormente caracterizar las secuencias amplificadas para comprobar la presencia de una región microsatélite, seleccionándose las más adecuadas para ser utilizadas para analizarlas en la etapa posterior. Teniendo en cuenta que el objetivo del proyecto es obtener un conjunto de marcadores genéticos (microsatélites) que permitan analizar poblaciones y forestaciones de las especies Pinus taeda y Araucaria angustifolia, hemos definido 5 objetivos específicos. Atendiendo a estos objetivos, las principales tareas y los aspectos sobresalientes de cada uno son: Ø      El primer objetivo es delimitar, analizar ecológicamente y muestrear poblaciones naturales y forestaciones de Araucaria angustifolia y de Pinus taeda. De esta manera se determinarán las características ecológicas y estructurales de las poblaciones de pino Paraná, asignándose un registro de procedencia. Asimismo las forestaciones de Pinus taeda deberán registrarse y en ambos casos seleccionar los individuos que por sus características fenotípicas son más representativos. Los individuos seleccionados serán muestreados. Ø      El segundo objetivo es obtener DNA genómico de las muestras colectadas, planteándose primeramente la estandarización en la extracción de DNA genómico de las especies en estudio. Para ello se aplicarán diversas técnicas descriptas para extracción de DNA vegetal, seleccionando la más adecuada en calidad y cantidad. Con la metodología seleccionada se obtendrá genoma de los individuos colectados en la etapa anterior. Ø      El tercer objetivo es diseñar primers específicos mediante herramientas bioinformáticas y a partir de datos genómicos disponibles para regiones microsatélites de las especies en cuestión o de ser necesario a partir de regiones descriptas para especies del mismo género. Ø      El cuanto objetivo busca estandarizar las condiciones para las amplificaciones, que se llevarán a cabo por PCR, y posteriormente caracterizar las secuencias amplificadas para comprobar la presencia de una región microsatélite, seleccionándose las más adecuadas para ser utilizadas para analizarlas en la etapa posterior.