Propiedades magnéticas en pares de bases de fragmentos de ADN

FERNANDO MARTINEZ; GUSTAVO A. AUCAR

Merlo, San Luis

Congreso; AFA100; 2015

AFA local

Los métodos teóricos empleados para el cálculo de apantallamientos magnéticos y constantes de acoplamiento entre espines nucleares a nivel no relativista, son herramientas excelentes en la interpretación de los parámetros experimentales de la NMR. Dentro del esquema de propagadores de polarización, los cálculos realizados al segundo orden de aproximación (second order polarization propagator approach, SOPPA), reproducen de manera muy confiable ambos parámetros. No obstante, el costo computacional impone límites en el número de funciones de base que pueden emplearse. En este trabajo se expondrán resultados preliminares de la aplicación de diferentes metodologías para el análisis de apantallamientos magnéticos en bases nitrogenadas constituyentes del ADN, a fin de establecer aquella que brinda los datos más confiables y el menor costo computacional. Una vez resuelta este problema se hace posible estudiar sistemas de mayor tamaño, como los dímeros adenina-timina y citosina-guanina. Se presenta tambien un estudio de efectos magnéticos de corto alcance que aparecen al considerar pequeñas secuencias de pares de bases, pertenecientes a un fragmento de ADN. Se plantea la posibilidad de determinar ubicación y tipo de par de base mediante el cálculo y medición de los parámetros magnéticos de la RMN.