Efecto solvente en las preferencias conformación ales de aminoácidos. ¿Modelo continuo o supermolécula

ANA M. RODRÍGUEZ, MIGUEL A. ZAMORA, MARCELO F. MASMAN, SEBASTIÁN A. ANDUJAR Y RICARDO D. ENRIZ

Buenos Aires-Argentina

Workshop; 1er Workshop Argentino de Química Medicinal; 2005

El agua juega un rol crucial en la regulación de la estructura y función deproteínas y otras macromoléculas biológicamente activas. Los estudios teóricos paraevaluar el efecto del solvente en sistemas moleculares de tamaño medio se puedenrealizar utilizando dos tipos de aproximaciones: el modelo continuo y el modelo de lasupermolécula. En el modelo continuo la molécula (soluto) es tratada con el solventerepresentado como un continuo dieléctrico polarizable que modula las interaccionesintramoleculares del soluto, interaccionando con el soluto a través de un campoeléctrico inducido o ambas cosas. La aproximación de la supermolécula involucraincluir explícitamente una o más moléculas del solvente en los cálculos, y determinarenergías conformacionales y propiedades relacionadas para la unión.Dentro de nuestro proyecto de investigación hemos realizado el estudioconformacional en fase gaseosa de numerosos aminoácidos en su aproximación diamidacon cadenas laterales cargadas y sin carga (polares y no-polares). Así hemos reportadoel hiperespacio conformacional de Glu (1), Gln (2), Trp (3), Cys (4) e Ile (5, 6). En elpresente trabajo presentamos los resultados obtenidos en el estudio conformacional decinco aminoácidos teniendo en cuenta el efecto del solvente mediante el empleo de laaproximación IPCM (Isodensity Polarized Continuum Model).