Búsqueda teórico-computacional de potenciales inhibidores de la proteasa NS1 del virus del dengue

PEREZ, JUAN CAMILO; BOLÍVAR AVILA, SANTIAGO J.

Bogota

Simposio; Simposio Internacional de Búsqueda de Nuevas Alternativas Antimicrobianas; 2021

Universidad Javeriana de Colombia

Entre los distintos retos actuales de la química medicinal esta la obtención de moléculasbioactivas selectivas en dianas terapéuticas específicas,1 la reincidencia de enfermedadesdesatendidas como el dengue,2 revierte la necesidad de explorar estructuras moleculares deorigen natural y/ó sintéticos que cumpla con efectividad en los distintos targets. Se estudió unaproteína no estructural en el virus del dengue, a la cual se le evaluó la afinidad de ligandos,través de la estrategia de cribado virtual con 44 productos naturales reportados en la literatura.Para ello, se eligió la proteasa NS1 de código PDB: 4OIG;3 sobre dicha proteína se eligió dossectores donde se concentraban el sitio activo cuyas coordenadas fueron (X,Y,Z) : 109.194, -26.677, 37.657; 105.024, -25.43, 28.646 respectivamente, con un tamaño de caja de 40 Å encada eje; con dichas coordenadas se realizó un cribado virtual utilizando el programa Easy DockVina 2.2 considerándose como criterios de afinidad alta afinidad (-8 a -9 Kcal/mol), medianaafinidad (-7.0 a -7.9 kcal/mol) y baja afinidad (-6.9 a -5 kcal/mol). Acorde a este protocolo, sepudo obtener, en el sitio 1: 13 ligandos con alta afinidad, 13 ligandos de mediana afinidad, y 18ligandos con baja afinidad, en lo que respecta al sitio 2 se pudo determinar 10 ligandos con altaafinidad, 22 ligandos de mediana afinidad, y 12 con baja afinidad. Los compuestos con altaafinidad se les realizó el cálculo de los descriptores moleculares y la geometría molecular fueoptimizada con Gaussian W09, realizando cálculos mecano-cuánticos, soportados en DFT conun nivel de cálculo B3LYP / 6-31G (2d), para así determinar propiedades de reactividad globaly local, su orbitales de frontera (HOMO y LUMO) naturales de enlace (NBO), Lo cual permitióconstatar la alta afinidad de estos ligandos convirtiéndolos así en potenciales ligandos de origennatural como inhibidores de la proteasa NS1.