Reporte preliminar sobre la secuenciación del genoma completo de virus papiloma humano tipo 16, agente etiológico del cancer de cuello de útero

TOTARO MARÍA ELINA; BADANO INÉS; COLLADO M. SOLEDAD; CAMPOS RODOLFO HÉCTOR; LIOTTA DOMINGO JAVIER

Posadas

Jornada; Jornadas Científico Tecnológicas del 40º Aniversario de la Universidad Nacional de Misiones; 2013

Universidad Nacional de Misiones

El Virus Papiloma Humano tipo 16 (HPV-16) es un virus de ADN doble cadena circular cerrado de aproximadamente 8 Kb y uno de los principales responsables del desarrollo de cáncer de cuello uterino, y se encuentra en el tracto genital del 3% de la población femenina asintomática y el 54% de los carcinomas a nivel mundial, con un valor estimado de riesgo entre la infección y el desarrollo de cáncer mayor a 400. La secuenciación del genoma completo permite el análisis simultáneo de todas las proteínas virales y también abordar cuestiones básicas sobre los mecanismos de evolución que operan sobre los HPVs. A pesar de su importancia no existen registros de secuencias de genomas completos de HPV-16 para la Argentina. El objetivo de este trabajo fue diseñar y poner a punto una técnica de PCR que permita amplificar y secuenciar el genoma completo de HPV-16 detectados en la provincia de Misiones. Se analizaron 5 muestras de ADN total extraído de células cervicales de mujeres infectadas con HPV-16 que pertenecían a la Genoteca del Laboratorio de Biología Molecular Aplicada (FCEQyN, UNaM). Se realizó el diseño de primer y la puesta a punto del protocolo de PCR. Los amplicones obtenidos fueron secuenciados en ambas cadenas usando servicios a terceros (Cromatida, Argentina). Los cromatogramas fueron analizados en el programa Codon Code Aligner v 3.0.1. (TM). Este proyecto permitió realizar el diseño de un protocolo de PCR directa para obtener la secuencia completa del genoma de HPV-16. Al día de la fecha se ha puesto a punto la secuenciación del 50% del genoma viral, permitiendo la caracterización de 5 muestras infectadas con HPV-16.