'USO DIFERENCIAL DE TRANSCRIPTOS EN LA INFECCION POR EL VIRUS DE LA LEUCEMIA BOVINA.'

CARIGNANO HA; PETERSEN, M.I.; MARCOS MIRETTI; TRONO, K.G.

Congreso; XIII Congreso Argentino de Virología; 2021

El Virus de la leucemia bovina (BLV) induce un desorden linfoproliferativo y una alta carga proviral (ACP) en algunos de los bovinosinfectados. Una ACP en sangre es asociada a la progresión dela infección hacia el desarrollo de linfosarcoma, no obstante, losmecanismos biológicos que modulan estos procesos no han sidodilucidados. Un evento clave en la transformación celular mediadapor virus oncogénicos es el secuestro de la maquinaria de splicingalternativo (SA) del hospedador, provocando un cambio en el patrón de expresión de las isoformas de un determinado gen.En este trabajo se evaluó la expresión de genes y el uso diferencialde transcriptos (UDTx) en bovinos infectados con BLV de ACP ybaja CP (BCP).Para tal fin, se secuenció el ARN mensajero total de células sanguíneas de bovinos caracterizados como ACP y BCP (n = 4, respectivamente) obteniéndose 354.4 M de lecturas. Las lecturasfiltradas (Trimmomatic v0.40) de cada muestra fueron alineadasal Transcriptoma bovino global (n = 43767) (ARS-UCD1.2) y laabundancia relativa de cada Tx fue calculada como Txs por millón(TPMs) (Salmon v1.2.1). La matriz de TPMs final contuvo 29730Txs correspondientes a 19302 genes. La misma, se utilizó paraidentificar los genes en los cuales la relación de expresión de susisoformas varía entre los grupos ACP vs BCP utilizando DRIMseqv1.20.0. Un total de 18 genes mostraron un significativo uso diferencial de transcritos (OFDR