Evaluación preliminar de un conjunto de 35 SNPs en un rodeo de bovinos lecheros.

MARIA AGUSTINA RASCHIA; ARIEL AMADIO; MARIA JOSE BERIBE; HUGO CARIGNANO; SUSANA COSTOYA; MARIO POLI

Mar del Plata

Congreso; 34° Congreso Argentino de Producción Animal ? 1st Joint Meeting ASAS-AAPA; 2011

Asociación Argentina de Producción Animal

Numerosos trabajos describen asociaciones entre variantes alélicas de polimorfismos de nucleótido simple (SNP) y características productivas en bovinos lecheros. Un estudio de asociación requiere de SNPs con una frecuencia alélica mínima (FAM) ≥ 5%. El objetivo de este trabajo es caracterizar un conjunto de 35 SNPs en un rodeo comercial de razas Holando y HolandoxJersey. El estudio se realiza como etapa preliminar a la determinación de asociaciones entre distintas variantes alélicas de SNPs y caracteres productivos y sanitarios. El ADN utilizado se extrajo de muestras de sangre fresca obtenidas a partir de 1492 animales. La genotipificación se realizó mediante la metodología SNPlexTM y la aplicación del programa GeneMapper v4.0. Se analizaron 35 SNPs correspondientes a genes candidatos relacionados con la producción lechera y la resistencia a enfermedades. La búsqueda de SNPs se realizó en la base de datos dbSNP del NCBI y se los ubicó en el contexto génico con el programa Artemis. Las frecuencias genotípicas y alélicas y el equilibrio de Hardy-Weinberg (HW) fueron estimados mediante programas convencionales. El 94.43% de las reacciones de genotipificación fueron exitosas. Siete de los 35 SNPs no resultaron informativos para la población estudiada (FAM ≤ 5 %), lo cual era predecible para algunos debido a la ausencia en la población de los alelos I de CSN3 y D y F de CSN1. Para 7 SNPs la población no se encuentra en equilibrio de HW. Las variantes de caseínas que predominan en la población analizada muestran una tendencia coincidente con la publicada a nivel internacional (91% variante B para αs1-caseína-, 65% variante A2 para β-caseína y 77% variante A para κ-caseína). En base a los resultados obtenidos, 28 (80%) de los 35 SNPs del set inicial podrán ser utilizados para realizar estudios de asociación en este rodeo.