Genómica comparativa intraespecie en bacterias: revelando el metaboloma secundario de Streptomyces albus, la especie tipo del género Streptomyces.

DIETRICH JULIÁN; SCHWAB, FLORENCIA; VELA GUROVIC, MARÍA SOLEDAD

Congreso; XLVIII Congreso Argentino de Genética; 2020

Sociedad Argentina de Genética

Streptomyces es un género ubicuo y tradicionalmenteconocido por su gran capacidad en la producción deantibióticos y otras moléculas bioactivas, típicamenteasociadas al metabolismo secundario. El desarrollode nuevas herramientas bioinformáticas ha hechoposible la bioprospección de metabolitos secundariosa nivel genómico, lo que evita el re-aislamiento demetabolitos conocidos y permite conocer el potencialmetabólico de una cepa. Recientemente, nuestrogrupo ha reportado el primer genoma completo deS. albus, lo que facilitó la realización de un estudiogenómico comparativo intraespecie. Se realizaronalineamientos de 9 genomas de S. albus disponiblesen GenBank con MAUVE (v20150226). Para predecirclusters genómicos de biosíntesis de metabolitossecundarios (CGBs) se utilizó ANTISMASH (v. 5.1.2).El metaboloma secundario central incluyó losmetabolitos ectoina, geosmina, desferrioxaminaE, hopeno y pseudouridimicina, junto con otrosmetabolitos que presentarían similitud estructuralcon sapB, isorenierateno e ibomicina. Adicionalmentese detectaron dos clusters no asociados a ningún CGBconocido que codificarían proteínas asociadas a lasíntesis de dos terpenos y un ciclodepsipéptido. Losresultados sobre el metaboloma auxiliar y único decada cepa revelaron que la mayoría de los clusters de laespecie S. albus, la cepa tipo del género Streptomyces,son huérfanos, es decir, aún no tienen asignado unmetabolito. Así, este estudio refleja que la diversidadmetabólica de algunas especies extensamenteestudiadas aún permanece oculta