ADN repetitivo en Solanum betaceum Cav. (Solanaceae)

SADER M. A.; MAGDALENA VAIO; JARAMILLO ZAPATA MM; TRENCHI A; CHIARINI F; LOPEZ A; URDAMPILLETA J.D

San Fernando del Valle de Catamarca

Congreso; Jornadas de la Sociedad Argentina de Botánica; 2023

Sociedad Argentina de Botánica

El tomate de árbol (Solanáceas) es originario de la región andina de América del Sur. Es popular para su consumo en jugos y como fruta fresca, constituyendo un complemento de nutrientes necesarios en la dieta. Posee 2n=24 cromosomas y un tamaño genómico grande. En Argentina, accesos de esta especie presentan diferencias fenotípicas. Para comprender y caracterizar la fracción repetitiva del genoma, secuenciamos el ADN de cinco poblaciones utilizando baja cobertura (0,1×). Realizamos un análisis de agrupamiento, ensamblamos los genomas de cloroplastos y ADN ribosomales y localizamos las repeticiones más abundantes mediante FISH. Observamos que todos los accesos tienen un tamaño genómico similar (21,58-23,60 pg) y que la fracción repetitiva constituye el 75% del genoma, siendo el retrotransposón Ty3/gypsy-Tekay (45%) es el más abundante. Además, identificamos cuatro familias distintas de ADN satélite, que conforman el 0,7% de la fracción repetitiva. Aunque los elementos repetitivos son compartidos por todos los accesos, la abundancia relativa de cada familia y de los ADN ribosomales varía. Los genomas plastidiales, a diferencia del nuclear, son altamente conservados (99%). Esto concuerda con estudios previos en otras especies de Solanaceae, donde se observó una acumulación de secuencias de ADN repetitivas, especialmente retrotransposones. Nuestros resultados confirman que este genoma es altamente dinámico en su fracción repetitiva, pero conservado en sus genomas plastidiales.