Análisis de viromas de ADN y ARN en muestras de aguas residuales recolectadas en Buenos Aires, Argentina.

ZAMBRANA MONTAÑO R.; BLANCO FERNANDEZ M.D.; TORRES C.

Otro; XLIII REUNIÓN CIENTÍFICA ANUAL DE LA SOCIEDAD ARGENTINA DE VIROLOGÍA; 2023

Los métodos de secuenciación de última generación (NGS) facilitan la detección de virus presentes en aguas residuales que pueden causar una variedad de enfermedades humanas y animales, al mismo tiempo que permiten la caracterización temprana de virus emergentes de relevancia para la salud pública. El objetivo de este trabajo fue realizar un análisis inicial del viroma de ARN y ADN de aguas residuales de cuatro muestras recolectadas en la provincia de Buenos Aires en distintos meses del año 2022.Se analizaron muestras (n=4) recolectadas en febrero, marzo, octubre y diciembre de 2022 del conducto que ingresa a la planta depuradora de líquidos cloacales de la localidad de Berisso, Provincia de Buenos Aires. Las muestras (2L) fueron concentradas a partir de una prefiltración con filtros de 0,45 y 0,22 μm, seguido de ultrafiltración (50 kDa) y precipitación con PEG. Luego, se realizó la extracción de ARN y ADN virales por separado con kits comerciales, y se implementó la estrategia de amplificación por cebador único independiente de secuencia (SISPA). Las secuencias, obtenidas con la plataforma Illumina (2x150), fueron procesadas mediante la eliminación de lecturas de baja calidad, el recorte de adaptadores, primers y lecturas cortas. La clasificación taxonómica de las lecturas restantes se realizó utilizando los programas Kraken2 y Bracken en comparación con la base de datos viral NCBI RefSeq.En las cuatro muestras de ARN se encontraron secuencias virales (10,9−30,3%), bacterianas (20,6−70,1%) y no clasificadas (18,8−48,7%). Entre las lecturas virales, a pesar de la sobrerrepresentación de la familia (~96.5%), se observaron especies de más de otras 30 familias, donde, por ejemplo, fue detectada en todo el año al igual que (con excepción de febrero 2022) y fue detectada solo a principio de año (febrero y marzo 2022).En las muestras de ADN se obtuvo una baja recuperación de secuencias virales (90%). La mayoría de los virus encontrados pertenecen al dominio (91,4% − 98,7%), conformado principalmente por fagos de ADN doble cadena del orden . En todas las muestras se encontraron a las familias , , , y , entre otras, en baja abundancia. La estrategia implementada en este trabajo permitió la detección de varias familias virales de diferentes especies hospedadoras en muestras de aguas residuales de Argentina. Los análisis posteriores permitirán una caracterización profunda de algunas de las especies virales y su diversidad.