Análisis de la conservación del ARN largo no codificante APOLO en especies de la familia de las Brassicaceas

IBARRA, VIRGINIA

Santa fe

Congreso; Encuentro de Jóvenes Investigadores; 2017

Universidad Nacional del Litoral

Las nuevas tecnologías de secuenciación de ARN permitieron revelar que a pesar de que una pequeña porción del genoma eucariota es traducible en proteínas, un porcentaje extraordinariamente superior es transcripto en ARNs no codificantes (ncARNs). La dilucidación del rol de estos ncARN es un nuevo desafío en la presente era de la biología molecular. Los ncARNs pueden ser procesados en pequeñas moléculas de menos de 50 nt tales como los microARNs o los ARNs de interferencia, que están involucrados en la regulación de la expresión de otros genes, tanto a nivel epigenético, como post-transcripcional. Por otro lado, existen otros ncARNs que pueden cumplir una función en su forma larga, mediante la participación en complejos ribonucleoprotéicos, y han sido caracterizados en la regulación epigenética de genes, el procesamiento de transcriptos, el control de la traducción, entre otros mecanismos moleculares. En plantas, los ARNs nocodificantes estarían asociados a la respuesta adaptativa al entorno y a la señalización de fitohormonas. En particular, un ARN largo no codificante (lncARN) de la especie Arabidopsis thaliana,llamado APOLO, fue caracterizado por su rol en la determinación dinámica de la conformación tridimensional de la cromatina, teniendo un impacto en la regulación de la expresión de su gen vecino, llamado PID. En este proyecto nos hemos propuesto develar cuál es el grado de conservación de APOLO en especies de la familia Brassicaceae y cuál es el rol de este lncARN en otras especies. Por lo pronto, hemos analizado el genoma de siete especies, logrando identificar mediante BLAST la presencia de secuencias homólogas a APOLO en otras dos especies del género Arabidopsis. Las secuencias fueron alineadas mediantes ClustalW, y se construyeron árboles filogenéticos basados en RAxML y MrBayes. Estos análisis preliminares nos han permitido determinar la existencia de una familia de lncARNs de APOLO, dividida en tres clados que incluyen a las cuatro copias de APOLO de Arabidopsis thaliana.