La supresión del cultivo de cobertura afecta la composición de la comunidad microbiana rizosféric

MORALES, MARIANELA ESTEFANÍA; IOCOLI, GASTÓN ALEJANDRO; ALLEGRINI, MARCO; BASUALDO, JESSICA; VILLAMIL, MARÍA BONITA; ZABALOY, MARÍA CELINA

BUENOS AIRES

Congreso; XXVIII Congreso Argentino de la Ciencia del Suelo.; 2022

ASOCIACIÓN ARGENTINA DE LA CIENCIA DEL SUELO

Sibien se han demostrado efectos positivos de los cultivos de cobertura invernales (CCI) sobre las propiedades físico-químicas del suelo, seconoce relativamente poco sobre las respuestas del microbioma de suelo yplantas ante la introducción de CCI y manejos asociados. En particular, el crecimiento de los CCI se finaliza conaplicación de herbicidas o labores mecánicas antes de la siembra del cultivo decosecha. Elobjetivo de este trabajo fue evaluar los efectos delmétodo de supresión (mecánico vs. químico)del CCI sobre la composición de la comunidad microbiana rizosférica de Avena sativa L. como CCI. El ensayo serealizó en parcelas con un diseño en bloques completos aleatorizados con cuatrorepeticiones, repetido en dos campañas agrícolas (2018/19 y 2019/20). La supresión del crecimiento del CCI (estadioZ5.5) se realizó mediante acción mecánica (R,rolo faca de tiro manual) o química (DQ, glifosato). Se obtuvo suelorizosférico antes de la supresión del CCI (sin supresión, SS) y de lostratamientos DQ y R cuando las plantas mostraron signos claros de desecación. Apartir del suelo rizosférico fresco se extrajo el ADN con un kit comercial. Lasecuenciación de la región V4 del ARNr 16S para bacterias y la región ITS para hongosse generó mediante la tecnología Illumina MiSeq.El procesamiento de datos y análisis bioinformático se llevó a cabo medianteQIIME2. Se realizó un análisis de componentes principales (ACP) con los datosde la tabla de los readsde las variantes de secuencias de amplicones transformados a centered log-ratio y clasificados a nivel de género. Los modelos lineales se ajustaron a cada CP utilizando el procedimientoGLIMMIX (SAS). Los resultados obtenidos mostraron que algunosgéneros bacterianos (incluyendo Chitinispirillum, degradador de quitina, y  Nocardioides, degradador de hidrocarburos)incrementaron su abundancia relativa en la rizósfera como consecuencia de laaplicación de ambos métodos de supresión, mientras que otros génerosconsiderados como rizobacterias promotoras del crecimiento vegetal (PGPR) (Duganella, Massilia, Erythrobacter, Novosphingobium,Phenylobacterium y Curvibacter) fueron negativamente afectados. Llamativamente, elR favoreció a bacterias PGPR (Methylobacterium) y disminuyó un género asociado con ladegradación de la materia orgánica (Stella). Además, tanto R como DQ incrementaron laabundancia relativa de géneros fúngicos identificados como patógenos vegetalesy saprófitos de suelo (Dokmaia, Haematonectria, Phialophoray Spizellomyces). Sería necesario un análisis más completo de lasinteracciones dentro de las comunidades microbianas rizosféricas afectadas porlas prácticas de manejo de los CCI para sugerir estrategias de manejo de losCCI que permitan mantener lasustentabilidad agrícola y ambienta