Caracterización de nuevos genes candidatos para un estudio de mapeo por asociación para la resistencia a la podredumbre húmeda del capítulo en girasol

FILIPPI CV; FUSARI CM; HOPP E; HEINZ RA; LIA VV; PANIEGO NB

Buenos Aires

Simposio; VIII Simposio Argentina 2011 "La Biotecnología entre nosotros"; 2011

REDBIO

El mapeo por asociación es una estrategia que utiliza los eventos de recombinación históricos y la diversidad nucleotídica en una población para encontrar genes causales de caracteres complejos. El desarrollo de un estudio de mapeo por asociación involucra la evaluación fenotípica del carácter de interés y la genotipificación de un conjunto apropiado de marcadores moleculares. El objetivo de este trabajo fue identificar genes involucrados en la respuesta de defensa frente a la infección con el hongo Sclerotinia sclerotiorum en girasol, para poder incorporarlos al estudio de resistencia a la Podredumbre Húmeda del Capítulo mediante mapeo por asociación de genes candidatos.A partir del análisis de perfiles de expresión de genes de B. napus en respuesta a la infección con S. sclerotiorum, se seleccionaron 28 transcriptos cuyos niveles de expresión se incrementaban en el genotipo resistente a las 24 h post infección. Para identificar los genes ortólogos en girasol, se estableció un protocolo de reconstrucción filogenética y se utilizó la información resultante para el diseño de iniciadores especie específicos. Se evaluaron 9 genes, para 7 de ellos se obtuvieron productos de PCR usando como templado ADN genómico de girasol. La validación de las secuencias obtenidas se realizó por similitud mediante búsquedas BLAST. Se analizaron estos 7 genes en un Grupo Núcleo de 10 líneas endocriadas incluidas en la población de mapeo, a fin de detectar SNPs e INDELs para su incorporación a la plataforma de Mapeo por Asociación. Los genes en evaluación contribuyen a incrementar a 26 la nómina de genes candidatos actualmente en estudio avanzando en la caracterización de la diversidad genómica funcional del girasol, tomando como base las accesiones preservadas en el banco de germoplasma de INTA, y en la identificación de polimorfismos candidatos a controlar las variaciones asociadas a caracteres agronómicos.