DESARROLLO E IMPLEMENTACIÓN DE UN ENSAYO DE GENOTIPIFICACIÓN MASIVA DE SNPS EN GIRASOL

ZUBRZYCKI J; FILIPPI CV; FUSARI CM; PUEBLA AF; FERNÁNDEZ P; HOPP E; HEINZ RA; LIA VV; PANIEGO NB

Rosario

Congreso; XV CONGRESO LATINOAMERICANO DE GENÉTICA - XLI CONGRESO ARGENTINO DE GENÉTICA - XLV CONGRESO DE LA SOCIEDAD DE GENÉTICA DE CHILE - II REUNIÓN REGIONAL SAG-LITORAL; 2012

SAG

La genotipificación de marcadores SNPs utilizandotecnologías de alto procesamiento está siendoadoptada rápidamente por los programas demejoramiento de distintas especies. Esto se debeal potencial que poseen estas técnicas en relaciónal incremento tanto en la velocidad como en laeficiencia de obtención de datos confiables, acostos moderados. En este trabajo se describe eldesarrollo de un panel de genotipificación de 384SNPs diseñado para realizar estudios de diversidad,de mapeo por asociación, de mapeo en poblacionesbiparentales y para caracterizar recursos genéticosen girasol. El conjunto de SNPs se obtuvo a partirde dos estrategias: (1) identificación in silito desitios variables realizada a partir del ensamblado desecuencias públicas de EST de girasol cultivado; (2)selección de genes candidatos en base a la anotaciónfuncional y posterior secuenciación y tipificaciónde SNPs sobre un conjunto de líneas endocriadasde girasol. Actualmente están llevando adelante demanera exitosa estudios piloto de genotipificaciónsobre una población no estructurada para mapeopor asociación y una población biparental de mapeode referencia. Sobre esta última ha sido posible laincorporación al mapa genético de 50 marcadoresSNPs (LOD= 3, frecuencia de recombinación=0,35) distribuidos de manera uniforme a lo largode los 17 grupos de ligamiento. Paralelamentese esta construyendo una base de datos de huellagenética basada en SNPs para la caracterización eidentificación de variedades.