INTERACTÓMICA ENTRE TRANSCRIPTOS EN DOS ESTADOS DE MADUREZ DEL FRUTO DE DOS GENOTIPOS DE TOMATE (Solanum spp.) DISCREPANTES PARA LA CALIDAD

CACCHIARELLI, PAOLO; ARCE, DÉBORA; ELIZABETH, TAPIA; GUILLERMO RAÚL, PRATTA

Congreso; IV REUNIÓN CONJUNTA DE SOCIEDADES DE BIOLOGÍA DE LA REPÚBLICA ARGENTINA ?Nuevas Evidencias y Cambios de Paradigmas en Ciencias Biológicas?; 2020

BG03- INTERACTÓMICA ENTRE TRANSCRIPTOS EN DOS ESTADOS DE MADUREZ DELFRUTO DE DOS GENOTIPOS DE TOMATE (Solanum spp.) DISCREPANTES PARA LACALIDADCacchiarelli P1,2*, Arce DP3*, Tapia E1, Pratta GR21CIFASIS, CONICET/UNR, 2IICAR, CONICET/UNR, 3CIT San Nicolás, CONICET/UTN. *ex aequo. email:darce@frsn.utn.edu.arAnalizando datos del cv. Heinz (H), cuyo genoma y trascriptoma son los de referencia para tomate cultivado (S. lycopersicum),se detectó expresión diferencial durante la madurez del fruto para los transcriptos de dos grupos de pequeñas proteínas de choquetérmico (sHSP, small Heat Shock Proteins) localizados en los cromosomas 6 (Chr6) y 9 (Chr9), respectivamente. En lostranscriptomas de cv. Caimanta (C, genotipo de tomate cultivado desarrollado en INTA Cerrillos, Salta) y LA722 (P, genotipo dela especie exótica S. pimpinellifolium, recolectado en Trujillo, La libertad, Perú y provisto por el Tomato Genetic ResourcesCenter, UCDavis, EEUU) se verificó la expresión diferencial encontrada en H, detectando adicionalmente variación genotípicarespecto a la diversidad fisiológica. Cabe aclarar que C y P son genotipos discrepantes para caracteres de calidad de fruto,empleados como progenitores de numerosas poblaciones de mapeo y mejoramiento genético desarrolladas por nuestro grupo detrabajo. Luego, se construyeron redes interactómicas para las sHSP de Chr6 y Chr9 de H y sus factores de transcripción,detectándose interactores que en conjunto contribuyen a mantener la homeostasis durante el proceso senescente de la madurez delfruto. El objetivo de este trabajo fue construir, en base a la transcriptómica de C y P en los estados Verde Maduro (VM), Pintón (Pi) y Rojo Maduro (RM), las redes interactómicas para las sHSP de Chr6 y Chr9, sus factores de transcripción y los interactorespreviamente detectados en H. Se trabajó con datos generados en nuestro laboratorio, obtenidos a partir de frutos cosechadossobre plantas crecidas en invernadero con condiciones ambientales totalmente controladas y disponibles para los interesadosmediante solicitud electrónica al autor de correspondencia. Las redes interactómicas se construyeron siguiendo métodosbioinformáticos estándares, obteniendo una red para cada genotipo en VM, Pi y RM. Se detectó expresión diferencial entre C y Ppara los 15 interactores identificados en H. En las redes interactómicas, se encontró que HSP70 (anotada internacionalmentecomo Solyc03g117630) aumenta su expresión en Pi y RM de C, genotipo en el que ya estaba presente en VM. En P, sin embargo,HSP70 y la ATPasa cloroplastídica FtsH (Solyc02g081550) se inducen solo en Pi. Únicamente el interactor GST(Solyc01g081270) y el factor de transcripción Proteína Nucleolar 12 (Solyc08g076660) reducen su expresión en Pi de P. Estosresultados sugieren que el genoma de P tendría un número más alto de las sHSP de Chr6 y Chr9 que las detectadas hasta elpresente, lo que puede explicarse por el hecho de que su genoma se alineó contra la referencia H cuando debería haber sidoensamblado de novo o bien, alineado contra alguna referencia de su misma especie. En conclusión, las redes interatómicasdetectadas para las sHSP de Chr6 y Chr9 son distintas entre C y P, lo que implica una regulación diferente de la homeostasisdurante el proceso senescente de la madurez y podría explicar la discrepancia entre los frutos de estos genotipos para caracteresde calidad.