Análisis filogenético molecular de arenavirus y ubicación de regiones conservadas para la detección de arenavirus emergentes.

POSIK, D., ALBARIÑO C., LOZANO, M., GHIRINGHELLI, P.D., ROMANOWSKI, V.

Villa Giardino, Córdoba

Congreso; XXXI Reunión Anual de la Sociedad Argentina de Investigaciones en Bioquímica y Biología Molecular.; 1995

Los arenavirus son virus envueltos con un genoma compuesto por dos segmentos de RNA de cadena simple (RMA-S .y RNA L), bisentido con respecto a la polaridad de los mRNAs. En general, el reservorio natural de estos virus es un roedor, y su ubicación geográfica está relacionada con el hábitat de los mismos. Todos los arenavirus, excepto LCM, tienen una distribución geográfica restringida. En la Argentina se han encontrado, hasta el momento, tres arenavirus; el virus Junín, agente de la fiebre hemorrágica Argentina; el virus LCM; agente de la coriomeningitis linfocitaria y el virus Oliveros. Este último fue aislado recientemente de poblaciones de roedores en la provincia de Santa Fe,.y no se conoce si provoca alguna. enfermedad en humanos. En ésta trabajo, se muestra el análisis filogenético obtenido de la comparación dé  las secuencias nucleotídicas conocidas de los genomas de los diferentes arenavirus caracterizados, y de las secuencias aminoacídicas de las proteínas que !os componen. Este análisis confirma la agrupación basada en ensayos serológicos entre los arenavirus del Nuevo y del Viejo mundo. Además, se ha realizado un alineamiento múltiple de secuencias nucleotídicas (PILEUP, GCG ­Wisconsin, VAX) de los RNAs genómicos S de los arenavirus, a partir del cual se definieron regiones de secuencias conservadas dentro de la familia. En base a este análisis, se diseñaron y sintetizaron oligonucleótidos que permiten amplificar por RT-PCR regiones homólogas de los genomas de los arenavirus. Estos fragmentos amplificados pueden ser caracterizados mediante secuenciación nucleotídica o por análisis con enzimas de restricción (RT-PCR/RFLP). Este último método puede ser empleado para detectar y caracterizar en forma rápida aislamientos de arenavirus hasta ahora desconocidos o emergentes, mediante su utilización en programas de screening de poblaciones de roedores. La secuenciación nucleotídica de los mismos, permitirá obtener la ubicación filogenética relativa de los arenavirus emergentes.