IDENTIFICACION DE RETROELEMENTOS TIPO LTR IN SILICO Y SU DISTRIBUCION CROMOSOMICA EN Capsicum annuum

ANAHÍ M. YAÑEZ SANTOS; PAZ, ROSALÍA; ANDINO, NATALIA; URDAMPILLETA, JUAN

Mendoza

Jornada; XXXVI Jornadas Argentinas de Botánica y XXVIII Reunión Anual de la Sociedad de Botánica de Chile.; 2017

SAB

Pimiento (Capsicum annuum) es una hortaliza perteneciente a la familia de las Solanáceas de gran valor económico y que cuenta con un gran número de cultivares comerciales y silvestres. Una gran porción del genoma de esta especie está constituida por retroelementos del orden LTR (del inglés, Long Terminal Repeats) con un potencial uso como marcadores moleculares para distinguir variedades. En trabajos bioinformáticos anteriores sobre el genoma de referencia de C. annuum cv. Zunla, hemos identificado 1235 retroelementos completos e intactos, de los cuales solamente 3 familias representan aproximadamente el 60% de los retroelementos detectados: GypsyZla_13 (6,2%), CopiaZla_01 (8,8%) y GypsyZla_16 (45,7%), perteneciente a los clados Del/Tekay, Retrofit/Ale y Athila respectivamente. El análisis de secuencias permitió el diseño de cebadores específicos sobre las regiones codificantes RT y RH. Los fragmentos amplificados por PCR, clonados y secuenciados, se utilizaron como sondas específicas en métodos de hibridación in situ fluorescente (FISH). Con el fin de comparar la distribución y abundancia relativa de estas familias dentro del genoma C. annuum, las mismas fueron utilizadas para comparar y caracterizar diferentes cultivares de pimiento comerciales y silvestres. Nuestros resultados sugieren que existe una distribución diferencial de dichos retroelementos entre los cultivares evaluados.Financiamiento: D-TEC 0008/13 (AGENCIA, MINCyT, Argentina). PROJOVI 2015 (UNSJ)