Desarrollo y optimización de método para aislar retrotransposones en Allium sativum L.

YAÑEZ A, GIMENEZ M, PAZ, ROSALÍA, GARCÍA LAMPASONA S.

Bariloche

Congreso; XLII Congreso Argentino de Genetica; 2014

El cultivo in vitro para obtener plantas de ajo libres de virus provoca variación somaclonal. Una de las posibles causas de dicha variación podría resultar de la activación de retrotransposones. Actualmente el estudio de estos elementos genéticos móviles en ajo es limitado debido a que existe poca información del genoma de esta especie. En estudios previos llevados a cabo por nuestro grupo, a partir de geles de poliacrilamida de MSAP (Methylation-Sensitive Amplified Polymorphism), logramos aislar y secuenciar 3 fragmentos homólogos correspondientes a las proteínas estructurales de retrotransposones del orden LTR, Superfamilia Ty3-gypsy. Las mismas presentaron longitudes de 304, 223 y 301 pb y se identificaron como RNasa H, retrotranscriptasa (RT) e integrasa (INT) respectivamente, presentando las dos primeras cambios hacia estados hipometilados desde el tiempo 6 a 12 meses de cultivo in vitro. A partir de las características estructurales y el ciclo de vida de los retrotransposones. El objetivo de este trabajo fue verificar la expresión de los retrotransposones a partir de ARNm procedentes de muestras A. sativum cv Fuego INTA, mediante el desarrollo de un método basado en PCR. Para ello, se diseñaron cebadores específicos a las regiones más conservadas a nivel nucleotídico y proteico. Los resultados revelaron la presencia de fragmentos de diferente longitud, entre 700 ? 1500 pb. Estos productos de amplificación, indicarían que diferentes transposones se estarían expresando activamente en el ARNm.