IDENTIFICACIÓN DE RETROELEMENTOS TIPO LTR IN SILICO Y SU DISTRIBUCIÓN CROMOSÓMICA EN Solanum lycopersicum L.

ANAHÍ MARA YAÑEZ SANTOS; URDAMPILLETA, JUAN DOMINGO; PAZ, ROSALÍA CRISTINA

RIO CUARTO

Congreso; LI CONGRESO ARGENTINO DE GENÉTICA y I JORNADAS REGIONALES SAG-CENTRO; 2023

SAG

El tomate (Solanum lycopersicum L.), es una hortaliza de gran valor económico, perteneciente a la familia de las Solanáceas. Esta planta cuenta con numerosos cultivares comerciales y silvestres. El tomate tiene un número cromosómico de 2n = 24 y un tamaño genómico de 0,95 Gb. Una parte del genoma esta compuesta por retroelementos del orden LTR (Long Terminal Repeats), los cuales tienen potencial como marcadores moleculares para distinguir variedades. En nuestro estudio, realizamos una anotación de retroelementos LTR en todo el genoma del tomate utilizando criterios estructurales, funcionales y de tiempo de inserción para identificar retroelementos potencialmente activos (completos e intactos). Destacamos las familias GypsySL_01 (clado Del) y CopiaSL_37 (clado TAR). Con el objetivo de comparar la distribución y la abundancia relativa de estas familias en tomate, diseñamos cebadores específicos para la región codificante de estos retroelementos y los utilizamos como sondas de hibridación in situ fluorescente (FISH). Nuestros resultados sugieren que existe una distribución diferencial de dichos retroelementos en el ADN cromosómico entre los cultivares evaluados. El patrón de hibridación se utilizó para comparar los cariotipos en cultivares comerciales (Heinz, Rio grande, Caroca) y criollas (accesiones 560 y 3832). Esta información es relevante para caracterizar la diversidad genética presente en el genoma de tomate, ofreciendo un recurso valioso para la genómica comparativa, el etiquetado de transposones y el diseño de marcadores moleculares específicos de cultivares en tomate.