Análisis de la diversidad filogenética de Escherichia coli en una cuenca urbana (Buenos Aires, Argentina) y su asociación con factores ecológicos y de infraestructura

SARACENO, MARTÍN; GÓMEZ LUGO, SEBASTÍAS; FRANKEL, NICOLÁS; GRAZIANO, MARTÍN

Chascomús

Taller; 2do Taller de la Red colaborativa en Ecología Microbiana Acuática en América Latina (μSudAqua); 2019

INTECH(UNSAM)-Universidad de la República de Uruguay-UFSCar

La ocurrencia de Escherichia coli (EC) en cuerpos de agua se asocia tradicionalmente a su ingreso por fuentes de contaminación fecal, aunque en las últimas décadas existe evidencia de su persistencia en ambientes secundarios, incluyendo procesos de adaptación (naturalización). Complementariamente, EC abarca una sub-estructura genética caracterizada en grupos filogenéticos discretos (filogrupos), para los que estudios recientes respecto a su ocurrencia en ambientes impactados sugieren la hipótesis de una supervivencia diferencial, incrementada en cepas pertenecientes a los clados B1 y a los llamados crípticos. En ese sentido, nuestro objetivo fue analizar en una cuenca metropolitana el efecto de factores urbanos y ecológicos sobre la diversidad filogenética de EC que puedan propiciar fenómenos de naturalización. Se realizó un muestreo en la cuenca de los arroyos San Francisco, Las Piedras y Santo Domingo (Febrero, 2018) en 14 sitios con diferencias a nivel de infraestructura sanitaria, hidráulica e integridad del hábitat ripario y acuático. Del total de aislamientos de EC recuperados, 326 fueron identificados filogenéticamente (PCR multiplex), obteniéndose un 64% de aislamientos correspondientes al filogrupo A, 16% al B1, 2% al B2, 10% al D, 3% al E y 5% al F. Se detectó, además, un aislamiento perteneciente al clado críptico IV . El arroyo San Francisco presentó la mayor diversidad filogenética de EC, dado que en la mayoría de sus sitios se detectaron taxones de baja frecuencia (B2, F y E) y el clado críptico. Un análisis de partición de la varianza asoció un 20% de la variabilidad en la composición filogenética de la cuenca a características urbanas (infraestructura de cloacas y agua potable como principales factores) y un 7% a las características ecológicas (nitratos y DOC). Estos resultados evidencian la presencia de una amplia diversidad filogenética de EC en ambientes secundarios, asociada tanto a factores relacionados con el ingreso de contaminantes como a la supervivencia de EC, identificándose por primera vez un clado críptico en Sudamérica.