CLASE DE LABORATORIO VIRTUAL UTILIZANDO METABOANALYST PARA ANÁLISIS LIPIDÓMICO EN UNA ASIGNATURA DE MICROBIOLOGÍA DURANTE LA PANDEMIA DE COVID-19

REYNA, MERCEDES; PEPPINO MARGUTTI, MICAELA; VILCHEZ, ANA CAROLINA; VILLASUSO, ANA LAURA

Río Cuarto

Jornada; XXIV JORNADAS CIENTÍFICAS SOCIEDAD DE BIOLOGÍA DE CÓRDOBA; 2021

SOCIEDAD DE BIOLOGÍA DE CÓRDOBA

La pandemia COVID-19 ha impactado tanto a los estudiantes como a los docentes de la Universidad de Río Cuarto tanto a nivel personal como académico, ya que han buscado adaptarse tanto al aprendizaje a distancia como al semipresencial. Al mismo tiempo, han surgido nuevas oportunidades para el diseño de clases de laboratorio virtuales en el campo de la multiómica, más específicamente en la lipidómica. Dado que el cierre impidió nuestras habituales clases de laboratorio presenciales centradas en ensayos bioquímicos de lípidos en tejidos vegetales, las reuniones en línea se centraron en cambio en el análisis de datos recopilados previamente. En 2020, el aumento de casos de COVID-19 y la consiguiente necesidad de reducir la interacción en persona hizo que la universidad diera un nuevo uso a su plataforma EVELIA (en inglés, Entorno Educativo Virtual Argentino Libre). La plataforma EVELIA permite las clases virtuales a través de Jitsi Meet, un proyecto de código abierto que le permite construir e implementar fácilmente soluciones de videoconferencia seguras. Así, el objetivo de nuestro proyecto era facilitar el cambio hacia clases virtuales que combinen el laboratorio virtual con actividades en línea. La plataforma integrada basada en la web MetaboAnalyst hizo posible hacer precisamente eso en nuestras reuniones de laboratorio en línea. Por lo tanto, un ejercicio de laboratorio originalmente pensado como un experimento se recicló en un modelo de laboratorio virtual. Un desafío importante en la lipidómica, en particular cuando se trata de enfoques basados en espectrometría de masas, radica en las demandas computacionales y bioinformáticas de manejar grandes cantidades de datos. Mostramos, cómo Metaboanalyst, una plataforma web integrada, hizo posible que los estudiantes con poca experiencia en estadística analizaran de forma exhaustiva datos lipidómicos cuantitativos. Los estudiantes realizaron un flujo de trabajo lipidómico completo que incluyó el diseño de experimentos, procesamiento de datos, normalización de datos y análisis estadístico de especies moleculares de fosfolípidos obtenidos de raíces de cebada. Además, aplicaron sus conocimientos de planificación del flujo de trabajo y procesamiento de datos experimentales al diseño de un ensayo de perfil lipídico para otro modelo biológico, el microorganismo Giardia.