Análisis del Mitogenoma del párasito nematodo Dioctophyme renale obtenido por tecnología de secuenciación de tercera generación Oxford Nanopore

MACCHIAROLI, NATALIA; SANANEZ, INÉS; ARCE, LUCAS; FRANCHINI, GISELA; KAMENETZKY, LAURA

Bucaramanga, Colombia

Congreso; V Congreso Colombiano de Bioquímica y Biología molecular C2B2-2023; 2023

Dioctophyme renale, conocido como el gusano gigante de riñón, es el nematodo parásito más grande de los vertebrados terrestres descrito hasta el momento y afecta a animales domésticos, animales silvestres -algunos amenazados - y a los seres humanos. D. renale pertenece al Clado I, el cual incluye otros nematodos parásitos más estudiados como los del género Trichuris y Trichinella. Sin embargo, no se cuenta con información genómica para D. renale. El objetivo de este trabajo fue secuenciar el genoma mitocondrial de D. renale mediante la tecnología de Oxford Nanopore (ONT). Para ello, se extrajo ADN total de alto peso molecular a partir de un gusano adulto. Se construyó una biblioteca de secuenciación y se sembró en la flow cell (R10.4.1) de la plataforma MinION para secuenciación por nanoporos presente en Buenos Aires, Argentina. Se realizó el análisis bioinformático de los datos obtenidos. El mismo incluyó asignación de bases (Guppy SUP, basecalling), filtrado por calidad y longitud (NanoPlot) y ensamblado De Novo (flye). A partir de 432.429 lecturas largas (1,79 Gb de bases totales) con un N50 de 8,35 Kb, ensamblamos un genoma mitocondrial preliminar de 20 Kb. En el genoma identificamos al gen mitocondrial cox1 con un 97% de identidad a una secuencia reportada previamente para D. renale por nuestro grupo obtenida mediante secuenciación por Sanger. El análisis de la información genómica generada para D. renale contribuirá a la identificación de genes esenciales y marcadores moleculares, como así también al conocimiento de la biología de un organismo perteneciente a una categoría taxonómica subrepresentada en las bases de datos públicas.