Análisis comparativo de diferentes protocolos para la extracción de ADN en hongos

POLICELLI, NAHUEL; O'DONOHE, AILIN; CINTO, ISABEL ESTHER; GALLY, MARCELA; RAMOS, ARACELI MARCELA

La Plata, Buenos Aires

Congreso; XXXIV Jornadas Argentinas de Botánica; 2013

Sociedad Argentina de Botánica

La extracción de ADN es un paso decisivo antes de la PCR. La presencia de ciertos metabolitos, como polisacáridos y compuestos fenólicos, puede interferir con los métodos de extracción y con la posterior restricción y amplificación. La heterogeneidad entre las especies fúngicas puede requerir diferentes protocolos. En este trabajo, se compararon el rendimiento y la calidad del ADN obtenido con tres protocolos de extracción: el de Gottlieb et al., (2001), que se utiliza de forma rutinaria en nuestro laboratorio y una modificación de los protocolos de Al-Samarrai y Schmid (1993), y de Kuhad et al. (2004) ambos métodos desarrollados para la extracción de ADN de hongos que producen polisacáridos. Se extrajo el ADN de cepas correspondientes a los géneros: Macrophomina, Grifola y Colletotrichum. Se encontró que el ADN extraído a partir de Colletotrichum graminicola por el método de Gottlieb dio muy bajo rendimiento y calidad de ADN. Los otros métodos testeados presentaron buen rendimiento, siendo el de Kuhad el que presentó mejor calidad del ADN extraído, constituyendo así un buen método de extracción para estas especies fúngicas.