INVESTIGADORES
ARCE Debora Pamela
libros
Título:
SABI2017-XXI Congreso Argentino de Bioingeniería y X Jornadas de Ingeniería Clínica
Autor/es:
PISTILLI, ALEJANDRO D; PRATTA, GUILLERMO; ANGELONE, LAURA ; ARCE, DÉBORA P
Editorial:
SABI
Referencias:
Año: 2017 p. 144
ISSN:
978-987-572-272-9
Resumen:
Se presenta el desarrollo de una arquitectura en pipeline que automatiza la descarga de promotores de Solanum lycopersicum desde la SolGenomics Network y luego los analiza con los programas MEME y TOMTOM. El código está disponible en www.github.com/lalebot/pip-prom-tom y utiliza Git como software de control de versiones. Se combina el uso de threads en Python, expresiones regulares y base de datos SQLite para que conjuntamente disminuyan el tiempo de descarga de los promotores y optimicen la utilización de recursos informáticos. La metodología que presenta este trabajo es potencialmente aplicable a otras áreas biológicas.
