INVESTIGADORES
ARCE Debora Pamela
congresos y reuniones científicas
Título:
Inducción diferencial de HSPs evaluada por ARN-Seq en dos especies de tomate (Solanum spp.) durante la madurez del fruto.
Autor/es:
ARCE, DÉBORA P; CACCHIARELLI, PAOLO; GIMÉNEZ MAGALÍ; RODRÍGUEZ GUSTAVO R; PRATTA, GUILLERMO RAÚL
Lugar:
Mendoza
Reunión:
Congreso; ALAG2019; 2019
Institución organizadora:
Sociedad Argentina de Genética
Resumen:
La expresión de los 33 miembros de la sub-familia génica de las small heat shock proteins (sHSPs) durante la madurez de tomate está bien caracterizada en el cultivar Heinz 1706 (H). Los genotipos Caimanta (C, S. lycopersicum) y LA0722 (P, S. pimpinellifolium) discrepan para caracteres del fruto tales como peso, vida poscosecha, acidez y dureza. El objetivo fue analizar la expresión a nivel de ARNm de sHSPs en C y P. Se secuenciaron los transcriptomas de C y P (NovaSeq, Illumina) en los estados verde maduro (V), pintón (Pi) y rojo (R). Los reads obtenidos se alinearon contra la región codificante de las 33 sHSPs de H utilizando el programa bowtie v.1.2.0. Para el análisis de expresión diferencial se utilizó edgeR. Se consideraron inducidos aquellos genes con un logFC >1,5 (p
