Interactómica entre proteínas del chaperone network en dos estados de madurez del fruto del tomate (Solanum spp. cv. Micro-Tom).

GOYTÍA BERTERO VALENTINA; PRATTA, GUILLERMO RAÚL; ARCE D

online

Conferencia; IVReunión Conjunta de las Sociedades Argentinas de Biología; 2021

Sociedad Argentina de Biología - Sociedad de Biologia de Rosario (SBR)

Las Heat Shock Proteins (HSPs o proteínas de choque térmico) son chaperonas identificadas en diferentes organismos, que junto a un grupo de otras proteínas (DnaJ) y sus factores de transcripción (HSFs) se asocian a respuestas frente a estrés abiótico interviniendo en el chaperone network. Se analizaron los patrones de expresión diferencial a partir del análisis de datos públicos generados mediante nano UPLC-MS/MS en cinco estados de madurez (EM) del fruto del tomate, cv. Micro-Tom: verde inmaduro, verde maduro, breaker, naranja y rojo, en dos tejidos, epicarpio (Ep) y mesocarpio (Me). El objetivo de este proyecto fue diseñar en base a datos públicos de proteómica redes interactómicas (RI) para los EM rojo-verde maduro en cada tejido, Ep y Me. Se analizaron las RI ya descriptas utilizando la plataforma Cytoscape v.3.8.0 y el algoritmo MCODE para identificar clusters sobrerrepresentados, destacándose grupos de proteínas altamente conectadas (3 clusters en Ep y 3 en Me). Posteriormente, se realizó un análisis de enriquecimiento funcional de los clusters identificados a partir de las RI, utilizando las plataformas GeneFam y PlantGSEA, (Fisher?s exact test, p ≤ 0,05 y el método Benjamini-Hochberg). Se observó que no sólo existen patrones de expresión diferencial en ambos tejidos en los diferentes EM, sino que también fue posible detectar nuevas familias de interactores expresados diferencialmente en Ep, como PAP fibrillin gene family (anotada internacionalmente como SOLYC08G006160, no caracterizada), phosphofructokinase (PFK) gene family (SOLYC11G010450, asociada al proceso de glucólisis) y Clp protease gene family (SOLYC02G088610, no caracterizada); mientras que en Me se observó la expresión diferencial de adenylate kinase (AMK) gene family (SOLYC08G077300, asociada con la síntesis de nucleótidos de pirimidina). Las familias de genes más representadas en ambos tejidos fueron DnaJ, HSP70, HSP20, Spermidine synthase gene family (SPDS), BAX inhibitor-1 gene family (BI-1), Cyclophilin gene family, Coactivator p15 gene family, Glutathione S-transferase gene family (GST), Tetratricopeptide repeat gene family (TPR) y Nitrilase gene family. Finalmente, se puede concluir que este abordaje bioinformático e inferencial basado en la construcción y análisis de RI, utilizando datos de proteómica reportados previamente, permiten aumentar el nivel de información necesario para la anotación funcional de proteínas menos estudiadas.