ANÁLISIS IN SILICO DE PROMOTORES Y TRANSCRIPTOS DE SMALL HEAT SHOCK PROTEINS (sHsps) EN DOS ESTADOS DE MADUREZ DEL TOMATE

ARCE, DÉBORA P; KRSTICEVIC, FLAVIA J; TAPIA, ELIZABETH; PRATTA, GUILLERMO

Mar delPlata

Simposio; XLIV Congreso Argentino de Genética . Análisis transcriptómico y de genes candidatos en el estudio de caracteres complejos; 2015

Sociedad Argentina de Genética

Las small Heat shock proteins (sHsps) son proteínas de bajo peso molecular (~20 kDa) ampliamente extendidas en todos los organismos vivos, que favorecen el plegamiento proteico y previenen la agregación celular frente a diversos tipos de estrés o procesos del desarrollo. Nuevas tecnologías de secuenciación como el RNA-Seq han permitido disponer de una gran cantidad de datos proveniente del genoma y transcriptoma de tomate (Solanum lycopersicum cv Heinz 1706). El presente trabajo utilizó datos públicos disponibles de experimentos de RNA-Seq para analizar la expresión de la familia génica sHsps en tres estadios de la maduración: verde o V, naranja o N y rojo o R. El presente trabajo abordó el análisis de expresión de la familia génica sHsps y algunas proteínas de tipo HSP20-like durante la maduración de los frutos de tomate por dos estrategias: cuantificación de los niveles de transcriptos (FPKM) y comparación de los niveles de transcriptos en fruto N y R con respecto a fruto V (Log2_FC). Los patrones de expresión fueron diferenciales según el estadio de maduración analizado: de un total de 59 posibles secuencias de sHsps, 20 se inducen diferencialmente en fruto N y R, siendo todas sHsps funcionales; 10 se reprimen (3 sHsps, 5 sHsps putativas, y 2 HSP20-like). El resto (29 secuencias) no se expresaron diferencialmente en fruto N y fruto R con respecto al V. Por último, 3 sHsps aportaron nueva evidencia experimental durante la maduración de los frutos de tomate: Solyc04g082740, Solyc01g098810 and Solyc01g096980. Se identificó un set mínimo de sHsps con diferente localización subcelular (cloroplástica, mitocondrial, retículo endoplásmico, citosólicas I y II) que estarían involucradas durante el estrés y el desarrollo de los frutos en S. lycopersicum (cv Heinz 1706). Los patrones de expresión de esta familia génica son diferenciales y sus mecanismos de regulación de la transcripción aún deben ser elucidados.