Detección de HSEs en promotores sHSPs en dos genotipos parentales de un programa de mejoramiento genético de tomate argentino

ARCE, DÉBORA P; CACCHIARELLI, P; TAPIA, ELIZABETH; PRATTA, GUILLERMO R

Journal of Basic & Applied Genetics

SAG ? Sociedad Argentina de Genética

Lugar: Buenos Aires; Año: 2018 vol. XXIX p. 62 - 62

1852-6233

Una gran diversidad de poblaciones que presentanvariancia genética para caracteres relacionados a lamadurez de los frutos ha sido derivada del cruzamientode tomate cv. Caimanta (C, Solanum lycopersicum) xLA0722 (P, S. pimpinellifolium), parentales cuyas secuenciasgenómicas se encuentran disponibles. Las smallheat shockproteins (sHSPs) constituyen una sub-familia génica cuyaestructura y expresión durante la madurez están biencaracterizadas por estudios previos de este y otros gruposen el cv. Heinz (H, de origen extranjero). El objetivo fueanalizar in silico en C y P, la arquitectura de las regionesregulatorias (promotores que se encuentran a 1000pbupstream del sitio de inicio de la transcripción) de 9genes de sHSPS duplicadas en tandem que se inducendurante la madurez en H. La metodología se basó en lautilización de matrices de probabilidades para detectar HeatShock Elements (HSEs), sitios de unión para los factores detranscripción del tipo HSFs (Heat Stress transcription Factors)frecuentemente presentes en los promotores de HSPs. Seidentificaron HSEs en la totalidad de los genes analizadosexcepto para dos sHSPs mitocondriales consideradas comopseudogenes en H. En C y P se detectó la presencia deHSEs diferenciales en el promotor de Solyc09g015000,ausente en H. Las diferencias encontradas indicarían unaregulación diferencial de este miembro de la familia delas sHSPs. Estas diferencias podrían ser empleadas paradesarrollar cebadores específicos que permitan detectarpolimorfismos moleculares potencialmente asociadas a lamadurez del tomate.