Detección y análisis de marcadores moleculares en camélidos sudamericanos

CORIA, MS; RIVERO, MB

San Miguel de Tucumán

Jornada; XIII Jornadas Científicas y Encuentro de Jóvenes Investigadores Augusto Palavecino; 2012

Facultad de Bioquimica Quimica y Farmacia

DETECIÓN Y ANÁLISIS DE MARCADORES MOLECULARES EN CAMÉLIDOS SUDAMERICANOS Coria, María Sumampa; Rivero, María Belén. Asesores: Longo, AE; Valdecantos, PA. Instituto de Biología - Fac. de Bioquímica, Química y Farmacia, UNT. Chacabuco 461 (4000) Tucumán. Argentina. (sumicoria@hotmail.com). Los Camélidos Sudamericanos (CS) comprenden dos especies domésticas, la alpaca (Vicugna pacos) y la llama (Lama glama), y dos silvestres, la vicuña (Vicugna vicugna) y el guanaco (Lama guanicoe). El estudio de los CS es de gran interés por diversos motivos; uno de los más evidentes es que de ellos se puede obtener una de las fibras más finas del mundo. Debido a que solo se conocen secuencias parciales del genoma de la alpaca y a que el genoma de ninguna de las otras especies fue secuenciado, el objetivo de este trabajo es identificar en el genoma de la vicuña marcadores genéticos que permitan detectar diferencias intra e interespecíficas. A partir de una mini biblioteca de ADN genómico de vicuña, obtenida previamente en nuestro laboratorio mediante el clonado de fragmentos de restricción de 2 a 5 kilo pares de bases (Kpb) de ADN genómico en el vector pBluescript, se seleccionaron clones para secuenciar sus extremos. En este trabajo se secuenciaron los extremos de dos clones seleccionados al azar; uno de ellos presenta homología con un exón del gen el gen USLP1; el segundo clon contiene secuencias similares a retrotransposones de la familia L1. A partir de las secuencias obtenidas, se diseñaron cebadores específicos con el programa Primer 3, que permitieron amplificar las secuencias homólogas en los otros CS. La secuenciación y posterior análisis y comparación de estas secuencias con el programa MEGA 5.02 permitió construir árboles filogenéticos usando el método Neighbor-Joining; las cuatro especies fueron agrupadas en dos clados: vicuña y alpaca; guanaco y llama. En los clones secuenciados se encontraron además, marcadores del tipo SNP, inserciones y deleciones. La secuenciación de una mayor cantidad de clones posibilitará la identificación de nuevos marcadores que permitan revelar diferencias interespecíficas y estudiar diversidad genética en poblaciones de CS.