INVESTIGADORES
MEDINA Rocio
congresos y reuniones científicas
Título:
El secretoma estimado del hongo hongo fitopatógeno stemphylium lycopersici CIDEFI-216
Autor/es:
FRANCO, MARIO EMILIO ERNESTO; LOPEZ, SILVINA; MEDINA, ROCIO; TRONCOZO, MARIA INÉS; LUCENTINI, GUSTAVO; SAPARRAT, MARIO CARLOS NAZARENO; BALATTI, PEDRO ALBERTO
Lugar:
Mendoza
Reunión:
Jornada; XXXVI Jornadas Argentinas de Botánica; 2017
Institución organizadora:
Sociedad argentina de botánica
Resumen:
El secretoma es el conjunto de proteínas exportadas por una célula. El estudio del secretoma de fitopatógenos es clave porque muchos efectores que modulan la interacción planta-patógeno son de naturaleza proteica. El objetivo del trabajo fue caracterizar el secretoma in silico del hongo fi topatógeno Stemphylium lycopersici CIDEFI-216. Este se predijo por la presencia en el proteoma teórico (GenBank: LGLR00000000.1) de péptidos señal de localización extracelular y ausencia de dominios transmembranales (SignalP 4.1). Se evaluó el contenido de enzimas activas sobre carbohidratos o CAZymes (dbCAN), peptidasas y sus inhibidores (MEROPS), lipasas y otras hidrolasas de éster carboxílico (LED) y efectores (EffectorP, PHI-base). Se encontró que S. lycopersici CIDEFI-216 tiene el potencial de secretar 1005 proteínas, incluyendo 356 CAZymes, 121 peptidasas, 9 inhibidores de peptidasas, 134 hidrolasas de éster carboxílico y 440 efectores. Estos datos son básicos para futuros estudios del secretoma in planta por el método de la huella peptídica.
