ANÁLISIS DE LA CAPACIDAD INFORMATIVA DE 13 MARCADORES GENÉTICOS EN LA IDENTIFICACIÓN DE ADN LIBRE DE DONANTE

TRUCCO BOGGIONE, CAROLINA; PRINCIPI, CINTIA; FERNANDEZ, JULIA; PISKULIC, LAURA; LUJÁN BRAJOVICH, MELINA ELIANA; MATTALONI, STELLA MARIS; ENSINCK, MARÍA ALEJANDRA; BIONDI, CLAUDIA; COTORRUELO, CARLOS

ROSARIO

Congreso; XXIV Congreso y XLII Reunión Anual de la SBR 2022; 2022

SBR

Los polimorfismos de inserción (In) deleción (Del) o INDELs son marcadores genéticos que se encuentran distribuidos a lo largo de todo el genoma y permiten identificar diferentes individuos. El ADN libre (cfDNA) es material genético que se encuentra presente en el plasma circulante y otros fluidos corporales. Se ha postulado que se origina principalmente a partir de las células hematopoyéticas por mecanismos de apoptosis, pero también proviene de tejido de órganos sólidos. En pacientes trasplantados, se encuentra también, aunque en menor proporción, ADN libre proveniente de la lisis y/o recambio de células del injerto. Se ha sugerido que un aumento en los niveles de ADN libre del donante en la circulación del receptor podría ser indicativo de daño del órgano trasplantado. Durante el rechazo, el contenido de las células del injerto se libera a la circulación del receptor, resultando el ADN nuclear un posible biomarcador específico para identificar daño y/o rechazo del órgano. Los marcadores genéticos INDELs permiten la detección de este ADN libre quimérico. La identificación del ADN libre de donante se realizará a través de la detección de una secuencia de inserción, pudiendo el donante tener un genotipo In/In o In/Del mientras que el receptor debe ser homocigota para la deleción. El objetivo de este trabajo es determinar la capacidad de 13 marcadores INDELs para la identificación de ADN libre del donante. Se investigó el perfil genético de 13 marcadores INDELs en 50 donantes de sangre. La probabilidad de identificar ADN libre del donante usando este panel de 13 marcadores se calculó en base a la distribución empírica de los genotipos de todos los posibles pares hipotéticos donante/receptor de órgano que pueden formarse con los 50 individuos donantes de sangre, considerándose que es posible diferenciarlos cuando hay al menos un marcador para el cual el receptor tiene resultado Del/Del mientras que el donante tiene resultado In/Del o In/In. Los perfiles genéticos obtenidos para los 50 donantes analizados permitieron armar 50 × 49 = 2450 pares hipotéticos donante/receptor y mostraron que aproximadamente el 92% (n=2264) tenían al menos un marcador que permitía diferenciar el material genético del donante y del receptor. Estos resultados nos permiten concluir que los 13 INDELs seleccionados resultan marcadores moleculares idóneos para la detección de ADN libre quimérico en nuestra población y podrán ser utilizados en los protocolos de estudio de ADN libre en embarazadas y pacientes trasplantados que se realizan en nuestro laboratorio.