ESTUDIO DE POLIMORFISMOS INDELs COMO POTENCIALES MARCADORES GENÉTICOS EN LA DETECCIÓN DE ADN LIBRE

TRUCCO BOGGIONE, CAROLINA; PRINCIPI, CINTIA; MATTALONI, STELLA MARIS; LUJÁN BRAJOVICH, MELINA ELIANA; ENSINCK, MARÍA ALEJANDRA; BIONDI, CLAUDIA; COTORRUELO, CARLOS

Congreso; XXIII CONGRESOy XLI REUNIÓN ANUAL DE LA SOCIEDAD DE BIOLOGIA DE ROSARIO; 2021

SBR

Los marcadores genéticos son secuencias de ADN con ubicación cromosómica conocida que permiten identificar diferentes individuos. Los polimorfismos de inserción/deleción (INDELs) son un tipo de variación genética en la cual una secuencia específica de nucleótidos está presente (inserción) o ausente (deleción). Si bien no son tan frecuentes como los polimorfismos de nucleótido único, se encuentran distribuidos a lo largo de todo el genoma y permiten una detección más específica ya que varían en por lo menos dos bases consecutivas. El ADN libre (cfDNA) es material genético que se encuentra presente en el plasma circulante y otros fluidos corporales. Se ha postulado que se origina principalmente a partir de las células hematopoyéticas por mecanismos de apoptosis, pero también proviene de tejido de órganos sólidos. Los marcadores genéticos permiten la detección de ADN libre quimérico generado en diferentes condiciones fisiológicas como embarazos y trasplantes. Este quimerismo molecular se debe a la presencia de células en el receptor que son genéticamente diferentes al resto de las células del paciente. El objetivo de este trabajo es determinar la capacidad de 13 marcadores INDELs para identificación de ADN libre del donante.estudiar diferentes polimorfismos de inserción/deleción (INDELs) y determinar su capacidad informativa como marcador genético para la identificación inequívoca del ADN libre. Se estudiaron 50 muestras de sangre periférica de dadores voluntarios sin patología demostrable, que concurrieron al Servicio de Medicina Transfusional del Hospital Provincial del Centenario. Se seleccionaron de la literatura 10 INDELs cuya frecuencia de deleción reportada se encuentre entre el 25% y el 80% y distribuidos en diferentes cromosomas. Se realizó el perfil genético de cada una de las muestras mediante reacciones de PCR de punto final utilizando cebadores específicos que reconocen secuencias por fuera de la región comprendida por cada INDEL de manera tal de identificar inserciones y/o deleciones. Los estudios de biología molecular demostraron que 6 de los INDELs analizados presentan frecuencias de deleción dentro del rango esperado para ser considerados biomarcadores informativos. Los resultados obtenidos nos permiten concluir que los INDELs resultan marcadores moleculares idóneos para la detección de ADN libre quimérico que podrán ser utilizados en los protocolos de estudio de ADN libre en embarazadas y pacientes trasplantados que se realizan en nuestro laboratorio. Sin embargo es necesario identificar un mayor número de INDELs que presenten frecuencias de deleción representativas en nuestra población.