Hidatidosis en la era genómica: Genoma de Echinococcus canadensis (genotipo G7)

LUCAS MALDONADO; JULIANA ASSIS; FLÁVIO GOMES ARAÚJO; NATALIA MACCHIAROLI; MARCELA CUCHER; MARA ROSENZVIT; GUILHERME OLIVEIRA; LAURA KAMENETZKY

Congreso; III Congreso Panamericano de Zoonosis. VIII Congreso Argentino de Zoonosis.; 2014

Hidatidosis en la era genómica: Genoma de Echinococcus canadensis (genotipo G7). Hydatid disease in genome era: Echinococcus canadensis (G7 genotype). Lucas L Maldonado1; Juliana Assis2; Flávio Gomes Araújo2; Natalia Macchiaroli, Marcela Cucher, Mara Rosenzvit1, Guilherme Oliveira2 and Laura Kamenetzky1 1-IMPaM, CONICET, Facultad de Medicina ? Universidad de Buenos Aires, Argentina 2- CEBio - CPqRR ? Fundación Oswaldo Cruz, Minas Gerais, Brazil. Palabras clave: Genoma, Hidatidosis, platelminto. Introduccion: Echinococcus canadensis es un parasito platelminto muy relacionado desde el punto de vista filogenético con Echinococcus granulosus y Echinococcus multilocularis, miembros de la clase cestode involucrados en infecciones hidatidicas en humanos y animales. En Suramérica se han reportado tres especies: E. granulosus s.s. (genotipos G1 y G2), E. canadensis (genotipos G6 y G7) y E. ortleppi. Hasta el momento se ha reportado limitada información genética de E. canadensis G7. El objetivo de este trabajo es secuenciar y analizar el genoma de esta especie. Materiales y métodos: Se extrajo ADN genómico de alta calidad de protoescolex de E. canadensis G7. Se construyeron bibliotecas ?paired-end? y la secuenciación se realizó con la tecnología Illumina. Se evaluaron varias metodologías usando diferentes parámetros hasta obtener el mejor ensamblado de novo mediante Velvet. Las lecturas fueron mapeadas sobre el genoma de E. multilocularis mediante BWA y se anotaron genes conservados utilizando CEGMA. Resultados: Estudios comparativos han revelado alto nivel de identidad nucleotídica, mayor al 95%, de E. canadensis G7, tanto con E. multilocularis como con E. granulosus s. s. G1. El procedimiento de anotación de genes in sílico realizado en este trabajo permitió identificar más de un 90% de los genes altamente conservados. Discusión: Este es el primer reporte del genoma de E. canadensis G7 obtenido mediante secuenciación paralela masiva que permite el abordaje del estudio genómico de esta especie. El conocimiento de la secuencia de este nuevo genoma permitirá realizar análisis de genómica comparativa y obtener información que podría utilizarse para la prevención diagnóstico de la hidatidosis.