Cálculo electrostático en el espacio de configuraciones posibles para la interacción ACBP-CPT1.

FERNANDO ZAMARREÑO; NATALIA PASQUALINI; DIEGO F. VALLEJO; MARCELO D. COSTABEL

Ciudad Autónoma de Buenos Aires

Congreso; 93 Reunión Nacional de Física Argentina y XI Reunión de la Sociedad Uruguaya de Física.; 2008

AFA y SUF.

Evidencia experimental propone que la proteína Acyl CoA Binding Protein (ACBP) se une a Carnitine-Palmitoyltransferase I (CPT-I) en presencia de ésteres de ácidos grasos de cadenas largas, participando como transporte de éstos últimos hacia la enzima receptora. En este marco, y utilizando modelos in silico y cristalográficos de las macromoléculas proponemos un mecanismo de interacción basado en cálculos computacionales. El presente trabajo continúa la línea ya iniciada en el estudio de la relación estructura-función de ACBP, donde fue explorado el paisaje de energía electrostática del complejo ACBP-Membrana lipídica. Para tal fin, diseñamos y desarrollamos una herramienta informática que, en este caso, nos permite explorar el espacio de energía dE(fi,theta, r) del sistema ACBP-CPTI. Los cálculos electrostáticos específicos fueron realizados con el software APBS (Adaptive Poisson-Boltzmann Solver) que utiliza un modelo mixto de Poisson-Boltzmann que representa al solvente como un continuo y las macromoléculas como una cavidad de baja permitividad con cargas puntuales. Se compararon los resultados para el espacio de configuraciones posibles sugiriéndose una configuración favorable para la interacción. El estudio permite asignar un rol importante a la Energía electrostática en el proceso de interacción ACBP- CPTI, encontrándose las configuraciones energéticamente más favorables que inducen a postular un mecanismo de interacción adecuado que permitiría a ACBP ser un posible partícipe del transporte de ácidos grasos hacia la mitocondria.