INVESTIGADORES
VANZETTI Leonardo Sebastian
congresos y reuniones científicas
Título:
TRIGUEROS: UNA PLATAFORMA WEB SOBRE GENÉTICA, GENÓMICA Y NUEVAS TECNOLOGÍAS DE INTERÉS PARA LOS PROGRAMAS LOCALES DE MEJORAMIENTO DE TRIGO.
Autor/es:
MUNOZ MEJIA I.; CRESCENTE J. M.; VANZETTI L.
Reunión:
Congreso; IX Congreso Nacional de Trigo; 2021
Resumen:
El objetivo de este trabajo es el desarrollo de una plataforma web de acceso libre donde seencuentre disponible información relevante y actualizada para los programas de mejoramiento detrigo de Argentina sobre selección asistida por marcadores moleculares (SAM), mapeo genéticobiparental y de asociación, genómica aplicada y nuevas tecnologías aplicadas al mejoramiento detrigo. Para el desarrollo de la plataforma web se utilizó un servidor PHP v7.2.24-0ubuntu0.18.04.1,la base de datos MySQL v5.7.34, mediante el sistema de gestión de contenidos de código abiertoWordPress v5.7.2 y la plataforma de desarrollo de sitios web Elementor v3.2.5. La aplicación decódigo abierto JBrowse v1.16.10 se instaló con el fin de poder observar la ubicación topográfica degenes, expresión génica y polimorfismos/mutaciones a lo largo de cada uno de los cromosomas enun set de variedades argentinas de trigo y poblaciones derivadas de proyectos de investigación. Laplataforma desarrollada posee el nombre de Trigueros (https://trigueros-ar.com/) y en su estructurase pueden encontrar seis grandes secciones de información. 1- Información sobre diversos tiposde marcadores moleculares asociados a caracteres de interés agronómico para ser utilizados enselección asistida por los programas de mejoramiento. Se detalla una batería de marcadoresfuncionales asociados a diferentes caracteres de interés agronómico (resistencia al estrés biótico yabiótico, calidad industrial, adaptación y rendimiento potencial), junto con una caracterización devariedades comerciales locales. 2- Información sobre QTL y regiones genómicas asociadas concaracteres de interés obtenidos mediante proyectos de mapeo de QTL biparentales o mapeo porAsociación. En esta sección se encuentra información sobre QTL detectados en ambientes localesde evaluación que junto a los marcadores asociados para incorporar dichos caracteres en losprogramas de mejoramiento. 3- Trigueros también ofrece información genómica de variedadeslocales de trigo obtenidas mediante captura y secuenciación de exones. En el JBrowse incorporadoen la plataforma se pueden detectar mutaciones para una gran cantidad de genes en variedadeslocales de trigo proveniente de proyectos de secuenciación tanto locales como extranjeros. Estainformación es de gran valor para conocer la variabilidad presente en el germoplasma local frente anuevos descubrimientos de genes de interés. 4- Software. Se comparten programas de accesolibre que pueden ser de utilidad para optimizar los programas de mejoramiento y minimizar loserrores. 5- Métodos y nuevas tecnologías aplicadas al mejoramiento. Esta sección ofreceinformación sobre metodologías de laboratorio y otros aspectos de interés para los programas demejoramiento local de trigo. 6- En la sección de noticias, se encuentra información de relevanciaactual para el cultivo de trigo en Argentina. Trigueros se ofrece como un punto de referencia paraestar actualizado de las problemáticas que enfrenta el mejoramiento de trigo en Argentina yposibles soluciones a las mismas. Los usuarios interesados también pueden estar actualizadossobre las novedades incorporadas en Trigueros a través de la cuenta de twitter, trigueroscontactos(@triguerosconta1).