Análisis de la variabilidad genética del Complejo Principal de Histocompatibilidad bovino mediante un arreglo de SNPs

GOSZCZYNSKI DE; FERNÁNDEZ ME; ROGBERG MUÑOZ A; LIRON JP; MORALES DURAND HF; POSIK DM; CARINO MH; PERAL GARCÍA P; GIOVAMBATTISTA G

Mar del Plata

Congreso; XLIV Congreso Argentino de Genética; 2015

Sociedad Argentina de Genética

El Complejo Principal de Histocompatibilidad(MHC) bovino es una región cromosómica deaproximadamente 21.984 Kb que incluye genes quecumplen un rol central en la respuesta inmune, y por lotanto, en los mecanismos de resistencia/susceptibilidada enfermedades infecciosas y autoinmunes. Es por estarazón que el estudio de la estructura y variabilidad delMHC (denominado BoLA en bovinos) es de graninterés para las ciencias biológicas. En el presenteestudio se analizaron 5.585 SNPs en 185 animalescorrespondientes a seis razas bovinas mediantela tecnología Axiom. Se estimaron los valores decallrate, frecuencia promedio del alelo menor (MAF),heterocigosidad esperada (He), bloques de ligamiento(LD) y distancia promedio entre marcadores. Losresultados obtenidos mostraron un valor promediode callrate de 99,48 (26,50 a 100) para los marcadoresutilizados. El valor de MAF resultó de 0,23 (0 a 0,5),resultando en un valor de He de 0,31 (0 a 0,616).El análisis de LD permitió identificar 1.165 bloquede ligamiento con un tamaño que varió entre 2 y29 marcadores, siendo la distancia promedio entremarcadores de 3.937 Kb. Según lo esperado, estosvalores variaron considerablemente cuando las razasse analizaron en forma independiente. Los análisisrealizados pusieron en evidencia que los marcadoresutilizados presentan suficiente información, tanto enrazas taurinas como cebuinas, para futuros estudios devariabilidad genética del BoLA y de asociación concaracteres sanitarios y de producción.