Evidencia de recombinación del género Allexivirus en ajo

CELLI M G; PEROTTO M C; LUCIANI C. E.; POZZI E. A.; CONCI V. C.

Congreso; 40º Congreso Argentino de Horticultura; 2018

asaho

Las especies del genero Allexivirus, de acuerdo a diferentesreportes infectan plantas de ajo en diversos países. Se conoce la existencia devarios subgrupos filogenéticos, pero hasta la fecha, los eventos derecombinación intra especies no han sido investigados. En este estudio sepropuso detectar posibles recombinaciones, el mayor y menor parentesco así comola localización de los puntos de quiebre en los genomas que contienen aprox.9.000 nucleótidos (nt). Para el análisis se utilizó el programa RDP4 v.4.93 conlos métodos RDP, GENECONV, Chimera, MaxChi, BootScan, SISCAN y 3Seq conmúltiple comparación y valor de p<0,01. Los eventos de recombinación fueronconsiderados significativos cuando se detectaron por tres o más métodos y conevidencia filogenética. Basándonos  en elconjunto de datos disponible (18 genomas completos), el análisis en RDP4 mostrócuatro potenciales eventos de recombinación con evidencia filogenética. Loseventos significativos mostraron que los recombinantes eran tres aislamientosde GarV-D (KR819505, KF550407, KF555653) y uno de GarV-E (AJ292230). Estoscuatro recombinantes mostraron eventos similares entre el aislamiento GarV-A(JX997952) y el aislamiento argentino de GarV-B (KM379144). Los resultadosencontrados indican que los aislamientos de GarV-D y de GarV-E estan formadospor la porción N-terminal del GarV-B (primeros 3.928 nt para los aislados GarV-Dy primeros 5.205 nt para el aislamiento GarV-E) y la porción C-terminal delGarV-A (últimos 4.489 nt para los aislamientos GarV-D y últimos 3.245 nt parael aislamiento GarV-E). Este es el primer informe de potenciales eventos derecombinación en el género Allexivirus.