Genomas completos de seis aislamientos de virus de ajo argentino.

CELLI M G; PEROTTO M C; CONCI V. C

Jornada; Tercera Reunión Conjunta de Sociedades de Biología de la República Argentina; 2015

MENCION ESPECIALGENOMAS COMPLETOS DE SEIS AISLAMIENTOS DE VIRUS DE AJOARGENTINOCelli, M.G.1; Perotto,M.C. 1,2; Conci, V.C. 1,21Consejo Nacional deInvestigaciones Científicas y Técnicas (CONICET); 2Instituto dePatología Vegetal (IPAVE) INTA; Camino 60 cuadras Km 5,5 (5119) Córdoba,Argentina. E-mail: conci.vilma@inta.gob.arLasplantas de ajo están infectadas sistémicamente por virus que infectan al cultivoy son responsables de importantes pérdidas en los rendimientos. Debido a laexclusiva propagación agámica del ajo los virus se transmiten de generación ageneración formando un complejo que infecta el total de las plantas. Hasta elpresente han sido citadas diferentes especies de los géneros Potyvirus, Carlavirus y Allexivirus. Con el objeto de obtenerlas secuencias completas de los virus presentes y detectar las combinacionesexistentes en ajos se realizó la extracción de RNA total de una muestra provenientede Mendoza y se secuencio mediante sistema de nueva generación (HiSeq1500 Illumina). Los contigs obtenidos fueron comparados por Blastn con la basede datos del GenBank y se detectaron 3 genomas completos de Allexivirus, 2 de Potyvirus y 1 de Carlavirus.Posteriormente los genomas fueron comparados mediante SDT 1,2 software consecuencias publicadas en GenBank. Los genomas de Allexivirus mostraron entre 72,3 y 82,1% de identidad denucleótidos con Garlic virus A(GarV-A), entre 84,3 % y 89,0% con Garlicvirus D (GarV-D) y entre 88,6 y 97,4% con secuencias parciales de Garlic virus B (GarV-B). Los 2 genomasde Potyvirus mostraron entre 78,4 y 87,8%de identidad con Onion yellow dwarf virus(OYDV) de ajo, y el Carlavirus mostróentre 92,4 y 94,1% de identidad con Garliccommon latent virus (GarCLV). En este trabajo se obtuvo por primera vez lasecuencia completa de un GarV-B y las primeras secuencias completas de GarV-A, GarV-D,OYDV y GarCLV de aislamientos argentinos, confirmando la presencia deinfecciones mixtas integrada por numerosos virus en el cultivo de ajo.