INVESTIGADORES
PEROTTO Maria Cecilia
congresos y reuniones científicas
Título:
Evidencia de recombinación en el gen de la cápside proteica de Garlic common latent virus
Autor/es:
CELLI M G; TORRICO, A.K.; PEROTTO M. C.,; CONCI V. C
Lugar:
Bariloche
Reunión:
Congreso; Actas del XLIII Congreso Argentino de Genética y IV Reunión Regional SAG- BARILOCHE; 2014
Institución organizadora:
Sociedad Argentina de Genetica
Resumen:
RECOMBINACIÓN
EN EL GEN DE LA CÁPSIDE PROTEICA DE GARLIC COMMON LATENT VIRUS Celli MG 1, AK Torrico1
, MC Perotto 1,2, VC Conci1,2.1 Instituto de Patología Vegetal (IPAVE) INTA;
Camino. 60 cuadras Km 5,5 (5119) Córdoba,Argentina.2CONICET. e-mail:
conci.vilma@inta.gob.ar En diversos países existen registros de infección de plantas
de ajo por Garlic common latent virus (GarCLV). Se conoce la existencia
de dos subgrupos filogenéticos, pero los eventos de recombinación intraespecies
no han sido investigados suficientemente hasta la fecha. En este estudio se
propuso detectar posibles recombinaciones, el mayor y menor parentesco y la
localización de los puntos de quiebre en el gen que codifica la cápside
proteíca (CP) que contiene aprox. 960 nucleótidos (nt). Para el análisis, fue
utilizando el programa RDP4 v.4.22 con los métodos RDP, GENECONV, Chimera,
MaxChi, BootScan, SISCAN y 3Seq con múltiple comparación y valor de P<0,01.
Los eventos de recombinación fueron considerados significativo cuando
detectados por tres o más métodos y con evidencia filogenética. Con base en el
conjunto de datos disponible (49 secuencias), el análisis en RDP4 mostró siete
posibles eventos de recombinación, de los cuales cinco de Polonia fueron
considerados significativos por mostrar evidencia filogenética. Cuatro recombinantes
mostraron mayor parentesco con aislamientos de Polonia (KF862692 y KF862695) y
menor parentesco en la región N-terminal con un aislamiento de Australia
(JQ899445) y que pertenece a otro grupo filogenético. El último recombinante
mostró mayor y menor parentesco con dos secuencias también de Polonia. El
análisis de la CP de los 49 aislamientos de GarCLV indicaron la existencia de 5
secuencias recombinantes, todas de Polonia. Financiamiento: INTA y CONICET.
