Identificación y caracterización molecular de Strawberry crinkle virus de frutilla en argentina

LUCIANI C. E.; CELLI M G; PEROTTO M.C.; TORRICO, A.K.; ASINARI F; CONCI V. C

Tucumán

Congreso; 3er Congreso Argentino de Fitopatología; 2014

Asociación Argentina de Fitopatólogos

IDENTIFICACIÓN Y CARACTERIZACIÓN MOLECULAR DE Strawberry Crinkle Virus DE FRUTILLA EN ARGENTINA   C. E. Luciani1, M. G. Celli2, M. C Perotto2, 3, A. K. Torrico4, F. Asinari5 y V. C. Conci2, 3 1 Beca Agencia Nacional de Promociones Científicas y Técnicas (FONCyT); 2 Investigador Consejo Nacional de Investigaciones Científicas y Técnicas (CONICET); 3 Investigador Instituto de Patología Vegetal (IPAVE) CIAP-INTA. 4Tesista Doctorado CONICET; 5Becaria CONICET. Autor correspondencia: conci.vilma@inta.gob.ar   Strawberry Crinkle Virus (SCV) es responsable de una importante reducción en el rendimiento y en la calidad de la fruta. La presencia de SCV fue detectado en Argentina desde 2010 en plantas de frutilla provenientes de Lules, Tucumán mediante RT-PCR anidado con cebadores específicos que amplificaron un fragmento de 573pb.  La secuencia de dicho fragmento reveló 84,1% de identidad con secuencias publicadas en el GenBank. En este trabajo fue utilizado el par de cebadores mencionado y se diseñaron dos pares nuevos que amplifican fragmentos de 744nt y 687nt respectivamente. Con los 3 juegos de cebadores mencionados se logró amplificar fragmentos de los tamaños esperados, que fueron clonados y secuenciados. El ensamblado de los 3 fragmentos genómicos permitió obtener una secuencia consenso de 1897nt. El porcentaje de identidad con secuencias publicadas en el GenBank varió entre 95,2% con un aislamiento de SCV de Alemania (AY250586 - cobertura 100%) y 89,1% con un aislamiento proveniente de los Países Bajos (AY331388 - cobertura 83%). Los resultados confirman la presencia del virus en las plantas de frutilla de Argentina con altos porcentajes de identidad con otros aislamientos publicados.   Trabajo realizado con fondos de INTA y FONCyT