PRIMERA SECUENCIA GENÓMICA COMPLETA DE UN AISLAMIENTO DE Cowpea mild mottle virus EN CHÍA

LUCIANI C. E.; BRUGO CARIVALI M. F.; PEROTTO M C; POZZI E. A.; CONCI V. C; CELLI M G

Corrientes

Congreso; 5° CONGRESO ARGENTINO DE FITOPATOLOGÍA >> 59th MEETING OF THE APS CARIBBEAN DIVISION; 2021

CPMMV es un miembro del género Carlavirus conocido por infectar plantas de la familiaFabaceae, Solanaceae y, más recientemente, chía (Salvia hispanica) de la familia Lamiaceae,causando pérdidas de rendimiento. El objetivo del estudio fue la obtención del genomacompleto de un aislamiento de CPMMV de chía para estudios filogenéticos. Para ello, plantasde chía con enanismo, deformación y/o clorosis en las hojas fueron recogidas de campos deproducción de Argentina y analizadas para detectar la presencia de CPMMV. La detección deCPMMV se realizó por DAS-ELISA utilizando suero anti-CPMMV (BIOREBA SRL LatinAmerica). Se extrajo el RNA de una planta y se secuenció en Illumina HiSeq 1500. Utilizandolas herramientas “ORF Finder” y BLAST, se identificó un contig de 8180 nucleótidos (nt) quecorrespondió al genoma completo de CPMMV. Se identificaron los 6 marcos de lectura, típicaorganización genómica de los Carlavirus. La identidad de nt del genoma completo fue de 92,71a 98,84% con otros 11 CPMMV publicados en GenBank. Utilizando el programa MEGA 6.06 seconstruyeron dos árboles filogenéticos con los CPMMV publicados. El árbol resultante de los12 genomas completos mostró que el aislamiento de chía se agrupó con 2 aislamientos deBrasil. El árbol de la región 3’UTR (ORF 2 al extremo 3’) a partir de 18 secuencias mostró queel aislamiento de chía se agrupó con los descriptos como causantes de síntomas severos ensoja en Brasil. El presente trabajo reporta, por primera vez, el genoma completo de unaislamiento de Cowpea mild mottle virus de Argentina.