?Rol crucial del genoma accesorio en el clon internacional 1 de Acinetobacter baumannii? TL0671.

ÁLVAREZ, VERÓNICA E.; VILACOBA E; QUIROGA MARÍA PAULA; RAMÍREZ MARÍA SOLEDAD; CENTRÓN, DANIELA

CABA

Congreso; XV Congreso Argentino de Microbiología (CAM 2019), XIV Congreso Argentino de Microbiología General (SAMIGE), V Congreso Argentino de Microbiología de Alimentos (V CAMA) y V Congreso Latinoamericano de Microbiología de Medicamentos y Cosméticos (CLAMME 201; 2019

Asociación Argentina de Microbiología

{Acinetobacterbaumannii} es un patógeno nosocomial con alta plasticidad genómica capaz deadquirir múltiples determinantes de resistencia antibiótica conducentes a ladiseminación y adaptación a la extrema y pandroga resistencia. El cloninternacional 1 (IC1) posee una diseminación global y una gran capacidad paraadquirir mecanismos de resistencia a los antibióticos. Realizamos estudios decomparación genómica para identificar características genéticas compartidas porlas cepas pertenecientes al IC1 de diferentes regiones geográficas. Luego,estudiamos el mantenimiento a través del tiempo de la isla genómica de tipo AbaR0 de la cepa A144. Dichacepa, que es la más antigua del IC1 secuenciada en nuestro país, se usócomo referencia en los estudios de comparación genómica. También utilizamos 7[dc1]  genomascompletos del IC1 y 5 genomas de otros clones internacionales y clonesesporádicos. Realizamos estudios bioinformáticos utilizando BLAST, RAST,ACT, MAUVE, Island Viewer, PHAST e ISFinder. Para el ensayode mantenimiento de la isla AbaR0, se cultivó una colonia de la cepa A144 a 37 °Cdurante 18 hs en 2 ml de caldo LB. Este cultivo se subcultivó durante 30 días. Losdías 1, 7 y 30, se analizaron 30 colonias para determinar la presencia de laisla genómica mediante PCR utilizando cebadores específicos. Los estudios bioinformáticosrealizados mostraron que el genoma A144 tiene una identidad nucleotídicapromedio del 99% con A155 aislada del mismo hospital. A su vez, estosgenomas tienen 97% de identidad con AYE, AB307-0294, AB5075-UW, AB0057, A1 y D36 (IC1), mientras que exhibieron 81% de identidad con ACICU (IC2), 83% con Naval-13 (IC3),79% con AB33405 (IC113), con A118 (clon esporádico) y también con ATCC 17978 (clonesporádico).  Aunque identificamos4 inversiones, 378 inserciones y 433 deleciones cuando se comparó el genoma de A144con los 7 genomas del IC1, observamos un alto grado de sintenia entre las cepasde IC1. Identificamos 7 regiones de plasticidad (RGP) dentro del genoma de A144.Las 7 RGP se encontraban sólo en el genoma de A144, 6 de ellas eran compartidascon A155 (RGP1, 2, 3, 4, 6 y 7) y 4 de ellas también se encontraban en AYE(RGP1, 4, 6 y 7), mientras que las RGP1 y RGP4 las detectamos en los 8 genomasdel IC1. Las RGP 2, 3 y 5 poseían elementos relacionados con fagos, sugiriendola adquisición de ADN foráneo. Observamos que las secuencias de inserción (IS)identificadas en los genomas de IC1 si bien eran compartidas por las cepas, nomantenían la ubicación genómica. La isla genómica tipo AbaR0 identificada enA144, se mantuvo al menos durante 831 generaciones en tres experimentosindependientes sin presión antibiótica. En resumen, por un lado, las cepasanalizadas del IC1 comparten una gran sintenia y preservan bloques del genomaaccesorio, y por otro, observamos características genómicas únicas en A144,reforzando la idea de la alta plasticidad de los genomas de {A. baumannii}.