INVESTIGADORES
QUIROGA Maria Paula
congresos y reuniones científicas
Título:
Cassettes inusuales y sus sitios de recombinación
Autor/es:
QUIROGA MARÍA PAULA; CENTRÓN DANIELA
Lugar:
Ciudad Autónoma de Buenos Aires
Reunión:
Jornada; 157º Jornada Científica titulada: Resistencia bacteriana y uso racional de los antibióticos; 2013
Institución organizadora:
Academia Nacional De Farmacia y Bioquímica de la República Argentina
Resumen:
Los
integrones son elementos genéticos claves en la captura, expresión y dispersión
de genes que se encuentran en forma de cassettes.
Codifican una recombinasa sitio específica, la integrasa (IntI), que reconoce el
sitio attI, adyacente al gen intI,y los sitios attC. A su vez, los cassettes son los elementos móviles de esta plataforma genética, y
están formados por un marco de lectura abierto (ORF) y un sitio attC. Los cassettes cobran vital importancia en salud pública, ya que
codifican determinantes de resistencia a todas las familias de antibióticos
utilizados en el tratamiento de las infecciones causadas por bacterias
gram-negativas. A partir de análisis de bioinformática evidenciamos la
presencia de tres grupos de cassettes
inusuales a los que denominamos ΔattI-like, ΔattC-like
y attC::Tn-like, cuya movilidad fue
cuestionada previamente por otros grupos pero que comprobamos en ensayos de
recombinación in vivo en el presente estudio. El objetivo de este
trabajo fue identificar la variedad de cassettes inusuales encontrados
en diferentes clases de integrones y analizar sus sitios de recombinación
atípicos, mediante estudios de bioinformática y experimentales. Para lograrlo,
realizamos su búsqueda en la base de datos GenBank, en la
literatura, e incluimos secuencias de nuestro laboratorio, con
diferentes herramientas de bioinformática tales como los
programas BLAST, mFold, RAC y XXR. El grupo ΔattI-like posee secuencias
provenientes de deleciones de sitios attI tanto de integrones de clase 1 como
de clase 2, en lugar de un
sitio attC típico. El
segundo grupo o ΔattC-like presenta secuencias no compatibles con las
del sitio attC típico o con el ΔattI-like, y su origen es más
incierto. Encontramos distintos
tipos de cassettes inusuales del tipo
ΔattC-like
en diferentes clases de integrones, en la zona variable de los integrones de
clase 1, 2, e incluso en integrones cromosómicos asociados a diferentes nichos
ecológicos. El tercer grupo posee al sitio attC
invadido por elementos móviles, ya sea por intrones del grupo II de clase C-attC,
o por transposones de la familia de la IS1111, lo cual resulta en sitios
attC inusuales más largos que contienen una compleja estructura
secundaria a nivel ADN. Además, al evaluar las estructuras
secundarias de los sitios de recombinación atípicos de cassettes inusuales cuya funcionalidad estudiamos tomando al menos
un representante por grupo en estudios de recombinación in vivo, encontramos patrones moleculares comunes entre los sitios
de recombinación típicos y atípicos que determinan su funcionalidad. En
base a estos resultados, pusimos en evidencia que los cassettes
inusuales no son exclusivos de una clase particular de integrones y consideramos que el análisis molecular y funcional de
estos cassettes puede aportar datos
sobre la captación de cassettes
inusuales, sobre cómo afectan a la dispersión de los cassettes y diseminación de determinantes de resistencia a
antibióticos así como sobre el origen de la formación de cassettes.